RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 LINC01387J3KSC0 135 aa14.84□□□□□ -0.03
TRPC1-201ENST00000273482 FBP1P09467 338 aa14.84□□□□□ -0.03
TRPC1-201ENST00000273482 COX6A1P12074 109 aa14.84□□□□□ -0.03
TRPC1-201ENST00000273482 SLC25A6P12236 298 aa14.84□□□□□ -0.03
TRPC1-201ENST00000273482 FAM78BQ5VT40 261 aa14.84□□□□□ -0.03
TRPC1-201ENST00000273482 FAM131CQ96AQ9 280 aa14.84□□□□□ -0.03
TRPC1-201ENST00000273482 COA4Q9NYJ1 87 aa14.84□□□□□ -0.03
TRPC1-201ENST00000273482 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa14.84□□□□□ -0.03
TRPC1-201ENST00000273482 AQP7P3A6NL99 342 aa14.83□□□□□ -0.03
TRPC1-201ENST00000273482 PGA4P0DJD7 388 aa14.83□□□□□ -0.03
TRPC1-201ENST00000273482 PGA5P0DJD9 388 aa14.83□□□□□ -0.03
TRPC1-201ENST00000273482 ARR3P36575 388 aa14.83□□□□□ -0.03
TRPC1-201ENST00000273482 TPPP2P59282 170 aa14.83□□□□□ -0.03
TRPC1-201ENST00000273482 HIST1H3AP68431 136 aa14.83□□□□□ -0.03
TRPC1-201ENST00000273482 FFAR4Q5NUL3 377 aa14.83□□□□□ -0.03
TRPC1-201ENST00000273482 OR52M1Q8NGK5 317 aa14.83□□□□□ -0.03
TRPC1-201ENST00000273482 COLCA2A8K830 154 aa14.83□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 BMP5P22003 454 aa14.83□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 PHYHD1Q5SRE7 291 aa14.83□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 CTDSP1Q9GZU7 261 aa14.83□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 LHFPL6Q9Y693 200 aa14.83□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 TNFSF4P23510 183 aa14.83□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 GABRA4P48169 554 aa14.83□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 EDDM3AQ14507 147 aa14.83□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM68Q96MH6 324 aa14.83□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 TECTBQ96PL2 329 aa14.83□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF391Q9UJN7 358 aa14.83□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa14.83□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 PITX3O75364 302 aa14.83□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 GAMTQ14353 236 aa14.83□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 CDCP2Q5VXM1 449 aa14.83□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 MRGPRGQ86SM5 289 aa14.83□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 KCNIP2Q9NS61 270 aa14.83□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 GPR27Q9NS67 375 aa14.83□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 TERTO14746 1132 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM50BP56557 158 aa14.82□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 SLC35E3Q7Z769 313 aa14.82□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF665Q9H7R5 613 aa14.82□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 TRGC1P0CF51 173 aa14.82□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 DEFB108BQ8NET1 73 aa14.82□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 C10orf35Q96D05 121 aa14.82□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 CRYAAP02489 173 aa14.81□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 BCL2P10415 239 aa14.81□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 OR10G4Q8NGN3 311 aa14.81□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 OR10G9Q8NGN4 311 aa14.81□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 OR10G7Q8NGN6 311 aa14.81□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa14.81□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 RNF151Q2KHN1 245 aa14.81□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 WFDC8Q8IUA0 241 aa14.81□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 RTN4RQ9BZR6 473 aa14.81□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 FKBP11Q9NYL4 201 aa14.81□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 EDDM3BP56851 147 aa14.81□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 RANP62826 216 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 OR8G1Q15617 311 aa14.81□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 SOX15O60248 233 aa14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 RTL8AQ9BWD3 113 aa14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 M0R1B8 84 aa14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 UBE2CO00762 179 aa14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 SP1P08047 785 aa14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 CCKARP32238 428 aa14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM211Q6ICI0 200 aa14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 RSG1Q9BU20 258 aa14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 FANCMQ8IYD8 2048 aa14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 C5orf52A6NGY3 159 aa14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 TIGITQ495A1 244 aa14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 SOX7Q9BT81 388 aa14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 TUBA4BQ9H853 241 aa14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 SH2D1BO14796 132 aa14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 SPINT2O43291 252 aa14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 ADCYAP1P18509 176 aa14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 RAB4AP20338 218 aa14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 ALKBH6Q3KRA9 238 aa14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 GFRALQ6UXV0 394 aa14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 MTCH1Q9NZJ7 389 aa14.8□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 ACTL6BO94805 426 aa14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF17P17021 662 aa14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 MDH2P40926 338 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 PRDX4Q13162 271 aa14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 DMRTA2Q96SC8 542 aa14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 ANGPTL4Q9BY76 406 aa14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 PMS2P1A4D2B8 440 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms