RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 DNAH12Q6ZR08 3092 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 BTBD17A6NE02 478 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 NPIPB9F8W1W9 429 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 J3QT63 122 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 MMP9P14780 707 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 ATP6V0CP27449 155 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 RAB13P51153 203 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 STARD6P59095 220 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 H3F3AP84243 136 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 CFHR1Q03591 330 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 GUCA2BQ16661 112 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 OR52L2PQ8NGH6 319 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 ZNF519Q8TB69 540 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 MOB3AQ96BX8 217 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 TAAR6Q96RI8 345 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 RAB40CQ96S21 281 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 ANGPTL4Q9BY76 406 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 DOCK4Q8N1I0 1966 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 C7orf77A4D0Y5 90 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 RGS13O14921 159 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 SLC31A2O15432 143 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 ZNF737O75373 536 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 FTH1P19P0C7X4 201 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 CD200P41217 278 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 CAMPP49913 170 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 P2RY4P51582 365 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 KRTDAPP60985 99 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 CEBPEQ15744 281 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 ANKRD55Q3KP44 614 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 SSX7Q7RTT5 188 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 HOGA1Q86XE5 327 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 ZNF561Q8N587 486 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 OR5A2Q8NGI9 324 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 RPEQ96AT9 228 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 PRO1933Q9H354 126 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 G6PC2Q9NQR9 355 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 SLC35D1Q9NTN3 355 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 FAM206AQ9NX38 181 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 FOXJ2Q9P0K8 574 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 HSF4Q9ULV5 492 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 A0A0G2JK05 382 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 MPTX1A8MV57 137 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 C21orf140B9A014 251 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 CLDN14O95500 239 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 GYPAP02724 150 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 FGF5P12034 268 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 COX6A1P12074 109 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 KCNJ3P48549 501 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 RBM11P57052 281 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 ZP4Q12836 540 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 HFEQ30201 348 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 FAM78BQ5VT40 261 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 COMMD1Q8N668 190 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 OR1L4Q8NGR5 311 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 R3HDM4Q96D70 268 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 CCL13Q99616 98 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 SAP30LQ9HAJ7 183 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 KCNIP2Q9NS61 270 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 LPAR3Q9UBY5 353 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 MED13Q9UHV7 2174 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 NOTCH4Q99466 2003 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 RBFOX3A6NFN3 312 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 HRASP01112 189 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 CT45A10P0DMU9 189 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 CTRB1P17538 263 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 THBS3P49746 956 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 TAS2R45P59539 299 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 IL13RA2Q14627 380 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 FNDC7Q5VTL7 733 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 CTRB2Q6GPI1 263 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 BTNL8Q6UX41 500 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 DTD1Q8TEA8 209 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 POM121Q96HA1 1249 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 CXXC4Q9H2H0 198 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 TNFSF18Q9UNG2 199 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 GPR132Q9UNW8 380 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 OR2W1Q9Y3N9 320 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 LOC285556D6RIA3 1793 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 IGF2RP11717 2491 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 FAM74A7A6NL05 159 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 PMCHP20382 165 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 TMEM50BP56557 158 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-201ENST00000261169 SLC35B1P78383 322 aa4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms