RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 BEND4Q6ZU67 534 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM45BQ96B21 275 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF799Q96GE5 643 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 AKAP6Q13023 2319 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 IFNA17P01571 189 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 PRH1P02810 166 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV1-2P23083 117 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 CHATP28329 748 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 MTCP1P56278 107 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 FABP9Q0Z7S8 132 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 OR8B8Q15620 311 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXW9Q5XUX1 488 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZT83 130 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5AC1P0C628 307 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 SULT1A1P50225 295 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 CLINT1Q14677 625 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 PIGTQ969N2 578 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 NABP1Q96AH0 204 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 SPOCK3Q9BQ16 436 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ELOVL5Q9NYP7 299 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 AK3Q9UIJ7 227 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF391Q9UJN7 358 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 POLQO75417 2590 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 AP4M1O00189 453 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ROS1P08922 2347 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 GNMTQ14749 295 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 KRBOX4Q5JUW0 171 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 PHYHD1Q5SRE7 291 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXW12Q6X9E4 464 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ETV3LQ6ZN32 361 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM185AQ8N0U4 392 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ABHD14BQ96IU4 210 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 C16orf97H3BN30 126 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 COX6B1P14854 86 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF266Q14584 549 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 WFDC1Q9HC57 220 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 PARPBPQ9NWS1 579 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 IL36GQ9NZH8 169 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 SPG11Q96JI7 2443 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PPH5 198 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 A6NLC8 198 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 CYSRT1A8MQ03 144 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 DHHO43323 396 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 CDS2O95674 445 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 HPSE2Q8WWQ2 592 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 CYYR1Q96J86 154 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF286AQ9HBT8 521 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC2A9Q9NRM0 540 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 C5orf63A6NC05 138 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM123Q8N131 208 aa22.39■■□□□ 1.17
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CAPNS1-201ENST00000246533 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 FAAP24Q9BTP7 215 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 NIT2Q9NQR4 276 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM27BQ5VT28 67 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 TOMM40LQ969M1 308 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 S100PBPQ96BU1 408 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 CADP27708 2225 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 K7N7A8 449 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 AKR1C3P42330 323 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC16A13Q7RTY0 426 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 LYZL2Q7Z4W2 148 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 SGK3Q96BR1 496 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
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CAPNS1-201ENST00000246533 THBDP07204 575 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 RBP2P50120 134 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB35Q15286 201 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 ALKBH2Q6NS38 261 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF565Q8N9K5 539 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4D5Q8NGN0 318 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 LIME1Q9H400 295 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEK2Q9NYT0 353 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 COX5AP20674 150 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 SOHLH1Q5JUK2 328 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 TECTBQ96PL2 329 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 SPIN2AQ99865 258 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PR80 420 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00587B1AMM8 73 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 SUMF2Q8NBJ7 301 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 CD300LFQ8TDQ1 290 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR173Q9NS66 373 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 CRYGSP22914 178 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 P2RY6Q15077 328 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 TAF9Q16594 264 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 SP6Q3SY56 376 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
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