RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602251.5

LTBP4-231, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 2

Gene LTBP4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-231	ENST00000602251	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251		Q8NFD4	153 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	C17orf98	A8MV24	154 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	F2RL2	O00254	374 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	RBP4	P02753	201 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	CSN2	P05814	226 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	SRM	P19623	302 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	CASC10	Q5T4H9	136 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	LINC00596	Q86U02	117 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	PHYHIP	Q92561	330 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	ARL6IP5	O75915	188 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	GLIPR1	P48060	266 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	NEK7	Q8TDX7	302 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	MALSU1	Q96EH3	234 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	LRRC42	Q9Y546	428 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		14.71	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	ODAM	A1E959	279 aa		14.71	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	SC5D	O75845	299 aa		14.71	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	UCHL1	P09936	223 aa		14.71	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	KCNJ3	P48549	501 aa		14.71	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	DLX6	P56179	175 aa		14.71	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	SSX2	Q16385	188 aa		14.71	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	MPV17L	Q2QL34	196 aa		14.71	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		14.71	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		14.71	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		14.71	□□□□□ -0.05
LTBP4-231	ENST00000602251	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		14.7	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	OR52W1	Q6IF63	320 aa		14.7	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	TCF23	Q7RTU1	214 aa		14.7	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		14.7	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		14.7	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	COQ2	Q96H96	371 aa		14.7	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	CST11	Q9H112	138 aa		14.7	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		14.7	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	GHRL	Q9UBU3	117 aa		14.7	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		14.7	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251		A0A1W2PP11	408 aa		14.69	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	ARG1	P05089	322 aa		14.69	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	UBB	P0CG47	229 aa		14.69	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	MGMT	P16455	207 aa		14.69	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	DYNLT3	P51808	116 aa		14.69	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		14.69	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	MUC7	Q8TAX7	377 aa		14.69	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	FCGR1B	Q92637	280 aa		14.69	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	CORO2A	Q92828	525 aa		14.69	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		14.69	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		14.69	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	BANF2	Q9H503	90 aa		14.69	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	IFT22	Q9H7X7	185 aa		14.69	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		14.69	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	KIF25	Q9UIL4	384 aa		14.69	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251		H3BUI4	141 aa		14.68	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	CDK2	P24941	298 aa		14.68	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	PSMB9	P28065	219 aa		14.68	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	GLP1R	P43220	463 aa		14.68	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	FABP5	Q01469	135 aa		14.68	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		14.68	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	SPART	Q8N0X7	666 aa		14.68	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		14.68	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	FAM46B	Q96A09	425 aa		14.68	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		14.68	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		14.68	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	ODF3B	A8MYP8	253 aa		14.67	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		14.67	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	HTR2C	P28335	458 aa		14.67	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	RANBP1	P43487	201 aa		14.67	□□□□□ -0.06
LTBP4-231	ENST00000602251	DGCR2	P98153	550 aa		14.67	□□□□□ -0.06

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.1 ms