RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM104Q8NE00 496 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 OR52M1Q8NGK5 317 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 OR10K1Q8NGX5 313 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 OR2T10Q8NGZ9 312 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 ASCL2Q99929 193 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 ALG8Q9BVK2 526 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 IFT22Q9H7X7 185 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 PLSCR3Q9NRY6 295 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM118AQ9NWS6 357 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF581Q9P0T4 197 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 DHDHQ9UQ10 334 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 SAC3D1A6NKF1 404 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 C15orf65H3BRN8 121 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 MOSP00540 346 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHG4P01861 327 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 RAB3AP20336 220 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 CD1BP29016 333 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 RSU1Q15404 277 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF260Q3ZCT1 412 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 NHLRC3Q5JS37 347 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 C1orf146Q5VVC0 180 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 ASCL4Q6XD76 172 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 LHFPL3Q86UP9 236 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 SATL1Q86VE3 508 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 SYS1Q8N2H4 156 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 SUMF2Q8NBJ7 301 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 OR8H1Q8NGG4 311 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 OR51A2Q8NGJ7 313 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 OR5AK2Q8NH90 309 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 LGALS12Q96DT0 336 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 S1PR3Q99500 378 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 GPER1Q99527 375 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 RASL11BQ9BPW5 248 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 HSPB9Q9BQS6 159 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM192AQ9GZU8 254 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 ST3GAL6Q9Y274 331 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 SNTNA6NMZ2 147 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 E9PI62 339 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 MAGEB3O15480 346 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 CDRT1O95170 752 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 HTR3BO95264 441 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 VDAC1P21796 283 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 IL3RAP26951 378 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 PSMB8P28062 276 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 RBM11P57052 281 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 Q3ZCU0 254 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 OR11H1Q8NG94 326 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 ARL11Q969Q4 196 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 GFOD1Q9NXC2 390 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 TAS2R4Q9NYW5 299 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 IL36GQ9NZH8 169 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF580Q9UK33 172 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 SORL1Q92673 2214 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 TXNL1O43396 289 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 ORC5O43913 435 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 IGF1P05019 195 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 ALPLP05186 524 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 OR8U8P0C7N1 319 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 GABRB1P18505 474 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 SOX6P35712 828 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 INSL3P51460 131 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF137PP52743 207 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 F2RL1P55085 397 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 CASC10Q5T4H9 136 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC00596Q86U02 117 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 OR52N1Q8NH53 320 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 MUC7Q8TAX7 377 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 UBALD1Q8TB05 177 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 KCTD7Q96MP8 289 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 JAM3Q9BX67 310 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 METTL9Q9H1A3 318 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 ERVK13-1Q9NX77 482 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 AASSQ9UDR5 926 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-226ENST00000593200 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms