RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 LIAT1Q6ZQX7 453 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 LGI3Q8N145 548 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 MICU1Q9BPX6 476 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 RTL8AQ9BWD3 113 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 PIGMQ9H3S5 423 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 H7C1Q1 480 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 RIPPLY3P57055 190 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 GABRA6Q16445 453 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 BAP18Q8IXM2 172 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 BVESQ8NE79 360 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 OR51I2Q9H344 312 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC2A9Q9NRM0 540 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 TREM2Q9NZC2 230 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 HOXB5P09067 269 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 RAC2P15153 192 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB32Q13637 225 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM76BQ5HYJ3 339 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 SHEQ5VZ18 495 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 STARD4Q96DR4 205 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 PLEKHA2Q9HB19 425 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 CDH20Q9HBT6 801 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 AKAP6Q13023 2319 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 FGF16O43320 207 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 PPYP01298 95 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 TK1P04183 234 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 COX5AP20674 150 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 GGNBP1Q5YKI7 109 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 C1orf174Q8IYL3 243 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 C18orf12Q96KH6 178 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 OBP2BQ9NPH6 170 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 CYTL1Q9NRR1 136 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP23Q9Y6H3 246 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 MED12LQ86YW9 2145 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 FREM1Q5H8C1 2179 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 LRP5LA4QPB2 252 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 TRDCB7Z8K6 153 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 GOSR1O95249 250 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF250P15622 560 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 CBR1P16152 277 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 IGHV1-2P23083 117 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 MDH2P40926 338 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF880Q6PDB4 577 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 TOMM40LQ969M1 308 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM100Q9NV29 134 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 GLS2Q9UI32 602 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 TMED3Q9Y3Q3 217 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 ITPR3Q14573 2671 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 SMPD2O60906 423 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 TUSC2O75896 110 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 AADACP22760 399 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 UQCC3Q6UW78 93 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 LDLRAD3Q86YD5 345 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM58AQ8N1B3 248 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 STPG2Q8N412 459 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 C17orf78Q8N4C9 275 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 DYRK2Q92630 601 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 TMUB1Q9BVT8 246 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5AC2Q9NZP5 309 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM210A6NLX4 147 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 MPTX1A8MV57 137 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 DEDDO75618 318 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP1CBP62140 327 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 Q6ZPA2 131 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 MOB1BQ7L9L4 216 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC5A7Q9GZV3 580 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 IQCF6A8MYZ5 107 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 WNT2P09544 360 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNJ3P48549 501 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 BEX5Q5H9J7 111 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 VWA1Q6PCB0 445 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 MBD6Q96DN6 1003 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 ABHD14BQ96IU4 210 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 PCDHB10Q9UN67 800 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PPR1 153 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB19A4D1S5 217 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-204ENST00000587718 SYNGR1O43759 233 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-204ENST00000587718 CGAP01215 116 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5AC1P0C628 307 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-204ENST00000587718 PRKACAP17612 351 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-204ENST00000587718 BRICD5Q6PL45 260 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4A4PQ8NGN8 299 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF141Q8WVD5 230 aa21.51■■□□□ 1.03
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