RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 A0A0G2JNJ9 132 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 TMEM89A2RUT3 159 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 OR5H15A6NDH6 313 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 UMAD1C9J7I0 102 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 TRIM77I1YAP6 450 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 ABCD4O14678 606 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 ST8SIA3O43173 380 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 LY86O95711 162 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 SEC11BP0C7V7 166 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 SLC25A6P12236 298 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 B4GALT1P15291 398 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 PAX1P15863 534 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 RPS2P15880 293 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 GABRR1P24046 479 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 PAX6P26367 422 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 FGF12P61328 243 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 BAXQ07812 192 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 MZT1Q08AG7 82 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 IL15RAQ13261 267 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 ZNF774Q6NX45 483 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 WDFY1Q8IWB7 410 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 OR51F2Q8NH61 342 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 TMEM230Q96A57 120 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 SMIM8Q96KF7 97 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 SEC11CQ9BY50 192 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 PRRG4Q9BZD6 226 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 WNT5BQ9H1J7 359 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 TAF9BQ9HBM6 251 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 Q9UFV3 132 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 CADP27708 2225 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 MED12Q93074 2177 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 HERC1Q15751 4861 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 PQLC2LA1A4F0 135 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 TRAPPC2LH3BP13 241 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 DEGS1O15121 323 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 NME2P1O60361 137 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 GPR137BO60478 399 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 ATG12O94817 140 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 CD79AP11912 226 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 NME2P22392 152 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 RPL12P30050 165 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 APLNRP35414 380 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 CD200P41217 278 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 LHX2P50458 406 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 PIGPP57054 158 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 RAB2AP61019 212 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 IL24Q13007 206 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 OR1C1Q15619 314 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 MSMO1Q15800 293 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 PHYHD1Q5SRE7 291 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 OTPQ5XKR4 325 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 SKA3Q8IX90 412 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 ZNF565Q8N9K5 539 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 LINC01560Q8TB33 94 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 BOD1Q96IK1 185 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 SEC22AQ96IW7 307 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 ZNF75AQ96N20 296 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 ZNF442Q9H7R0 627 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 GPR173Q9NS66 373 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 DSCAMO60469 2012 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 TMEM218A2RU14 115 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 TMEM210A6NLX4 147 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-218ENST00000584243 HSPA12AO43301 675 aa6.85□□□□□ -1.31
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