RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578501.5

CSNK1D-208, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-208	ENST00000578501	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	GAPT	Q8N292	157 aa		11	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR9G1	Q8NH87	305 aa		11	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		11	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	BANF2	Q9H503	90 aa		11	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		11	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		11	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		11	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	TCF19	Q9Y242	345 aa		11	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		11	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501		A6NDX4	124 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	OOSP1	A8MZH6	123 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	LY6L	H3BQJ8	138 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	TOR1A	O14656	332 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	ORC5	O43913	435 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	HTR2C	P28335	458 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	CEACAM3	P40198	252 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	RANBP1	P43487	201 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	KIR2DS4	P43632	304 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	PROK1	P58294	105 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	FABP5	Q01469	135 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	LY6E	Q16553	131 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	RAB12	Q6IQ22	244 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	BRICD5	Q6PL45	260 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	SVOP	Q8N4V2	548 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	FAM172BP	A6NC97	362 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	C15orf65	H3BRN8	121 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	CHST1	O43916	411 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	PDCD6	O75340	191 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	BPNT1	O95861	308 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	VSIG8	P0DPA2	414 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	GAL	P22466	123 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	NFYB	P25208	207 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	SSTR5	P35346	364 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	RAB13	P51153	203 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	PSMD7	P51665	324 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	ARHGDIB	P52566	201 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	QRFP	P83859	136 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	SSX1	Q16384	188 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	C11orf88	Q6PI97	169 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	NEK7	Q8TDX7	302 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	CITED1	Q99966	193 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	TM2D1	Q9BX74	207 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	MMP28	Q9H239	520 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	RAB9B	Q9NP90	201 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	ETAA1	Q9NY74	926 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	LRRC42	Q9Y546	428 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501		J3QR06	171 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	AIP	O00170	330 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	F2RL2	O00254	374 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC17A2	O00624	439 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	MPIG6B	O95866	241 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	BRS3	P32247	399 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	PLA1A	Q53H76	456 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	UTF1	Q5T230	341 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	SPART	Q8N0X7	666 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	RFESD	Q8TAC1	157 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	FCGR1B	Q92637	280 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	ARL11	Q969Q4	196 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	FAM46B	Q96A09	425 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	GFI1	Q99684	422 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	PSG11	Q9UQ72	335 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	UNC119	Q13432	240 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501		Q3ZCU0	254 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	C6orf183	Q5T699	404 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	10.96	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR10K2	Q6IF99	312 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		10.96	□□□□□ -0.65
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		10.96	□□□□□ -0.65

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