RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM222BQ8WU58 562 aa24.42■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 GALNT14Q96FL9 552 aa24.42■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 KIRREL1Q96J84 757 aa24.42■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 METRNQ9UJH8 293 aa24.42■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCSO14618 274 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 IRF2P14316 349 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 IFITM2Q01629 132 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 FGL1Q08830 312 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDSNQ15517 529 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 GSG1LQ6UXU4 331 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 GRPEL2Q8TAA5 225 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 SNX22Q96L94 193 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 EGLN1Q9GZT9 426 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 SHARPINQ9H0F6 387 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNF115Q9Y4L5 304 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 OOEPA6NGQ2 149 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 AESQ08117 197 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 COQ2Q96H96 371 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLA2Q9H6Q3 261 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 TAF9BQ9HBM6 251 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 KIF25Q9UIL4 384 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR2W1Q9Y3N9 320 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF737O75373 536 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 EFNB3Q15768 340 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 KRBOX4Q5JUW0 171 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 GON7Q9BXV9 100 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZZEF1O43149 2961 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRAV39A0A0B4J263 110 aa24.39■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM25EA8MYX2 175 aa24.39■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 GABRA2P47869 451 aa24.39■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 RND3P61587 244 aa24.39■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 CYCSP99999 105 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 PHLDA2Q53GA4 152 aa24.39■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 C6orf183Q5T699 404 aa24.39■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 SECTM1Q8WVN6 248 aa24.39■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 IL1F10Q8WWZ1 152 aa24.39■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 SUCNR1Q9BXA5 334 aa24.39■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC5A7Q9GZV3 580 aa24.39■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 COMMD9Q9P000 198 aa24.39■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 C5orf51A6NDU8 294 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 HMSDA8MTL9 139 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPR31O00270 319 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 TFF1P04155 84 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 GNRHRP30968 328 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 C4orf17Q53FE4 359 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 GALNT11Q8NCW6 608 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 MS4A5Q9H3V2 200 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRRC30A6NM36 301 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 B9A039 149 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 RGS13O14921 159 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCL8P80075 99 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 TFF3Q07654 80 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRAT1Q6PIZ9 186 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANGPTL6Q8NI99 470 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 NEUROG1Q92886 237 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 MGST3O14880 152 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 CD80P33681 288 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRR18Q8N4B5 295 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 SEC22AQ96IW7 307 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 LURAP1Q96LR2 239 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 NMES1Q9C002 83 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRR13Q9NZ81 148 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 HSPA12AO43301 675 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 DYNLRB1Q9NP97 96 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 DYSFO75923 2080 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGKV1-13P0DP09 117 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM187Q14656 261 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF561Q8N587 486 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 GALMQ96C23 342 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 SAP30LQ9HAJ7 183 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR1A1Q9P1Q5 309 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 MPPED1O15442 326 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 HEXAP06865 529 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR5AC1P0C628 307 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 GLIPR1P48060 266 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 TEX36Q5VZQ5 186 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 LDLRAD3Q86YD5 345 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 CMTM1Q8IZ96 169 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR5D13Q8NGL4 314 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 DNTTIP1Q9H147 329 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 ICE1Q9Y2F5 2266 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 C12orf77C9JDV5 145 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 K7N7A8 449 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADAP1O75689 374 aa24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms