RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567329.1

USP7-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 7, human

TSL 4

Gene USP7, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP7-217	ENST00000567329	IGKV3-11	P04433	115 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	CD99	P14209	185 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	KLK2	P20151	261 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	FUT3	P21217	361 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	OR3A1	P47881	315 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	PCP4	P48539	62 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	YPEL5	P62699	121 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	VAMP2	P63027	116 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	PAFAH1B2	P68402	229 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	C1orf189	Q5VU69	101 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	OOSP2	Q86WS3	158 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	CARF	Q8N187	725 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	SNX22	Q96L94	193 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	OR5B12	Q96R08	314 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	DIRC2	Q96SL1	478 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	GPER1	Q99527	375 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	MSL2	Q9HCI7	577 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	IL36G	Q9NZH8	169 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329		A0A1W2PPQ1	181 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	MPPED1	O15442	326 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	KBTBD11	O94819	623 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	DIRAS3	O95661	229 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	SEMA4F	O95754	770 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	HRAS	P01112	189 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	QDPR	P09417	244 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	NR2C1	P13056	603 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	VDAC1	P21796	283 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	APLNR	P35414	380 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	VIPR2	P41587	438 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	TNFRSF4	P43489	277 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	DYNLT3	P51808	116 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	HIST1H3A	P68431	136 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	ZNF92	Q03936	586 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	MESP2	Q0VG99	397 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	BSX	Q3C1V8	233 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	ZNF774	Q6NX45	483 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	GATS	Q8NAP1	163 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	NAXE	Q8NCW5	288 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	SPSB1	Q96BD6	273 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	RAB40C	Q96S21	281 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	STARD5	Q9NSY2	213 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	NAGK	Q9UJ70	344 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		5.98	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	TMEM131	Q92545	1883 aa		5.97	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		5.97	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		5.97	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		5.97	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		5.97	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		5.97	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		5.97	□□□□□ -1.45
USP7-217	ENST00000567329	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		5.97	□□□□□ -1.45

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