RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 KIF25Q9UIL4 384 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 A3GALT2U3KPV4 340 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 A8MXK9 166 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 C15orf65H3BRN8 121 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 H7C1Q1 480 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 J3QRK9 145 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 IFNL4K9M1U5 179 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 NDUFS8O00217 210 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 SH2D1BO14796 132 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 RGS5O15539 181 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 MT-ND4P03905 459 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 CSN2P05814 226 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 CD3GP09693 182 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.81□□□□□ -1.32
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TMOD3-211ENST00000561438 SSTR5P35346 364 aa6.81□□□□□ -1.32
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TMOD3-211ENST00000561438 PITPNBP48739 271 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 IFITM3Q01628 133 aa6.81□□□□□ -1.32
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TMOD3-211ENST00000561438 GRK1Q15835 563 aa6.81□□□□□ -1.32
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TMOD3-211ENST00000561438 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 CDNFQ49AH0 187 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 HCP5Q6MZN7 132 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 Q6ZTK2 550 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 BTN2A1Q7KYR7 527 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF561Q8N587 486 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 OR4K15Q8NH41 348 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 OR52I2Q8NH67 350 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC107Q8WV48 283 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 RAB1CQ92928 201 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 TRIM63Q969Q1 353 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 RAB3CQ96E17 227 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 SNX22Q96L94 193 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 S100A13Q99584 98 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 SRRQ9GZT4 340 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 MMP27Q9H306 513 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 RHOFQ9HBH0 211 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 HSF4Q9ULV5 492 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 FAM172BPA6NC97 362 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 C12orf77C9JDV5 145 aa6.8□□□□□ -1.32
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TMOD3-211ENST00000561438 P2RX3P56373 397 aa6.8□□□□□ -1.32
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TMOD3-211ENST00000561438 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 HACD4Q5VWC8 232 aa6.8□□□□□ -1.32
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TMOD3-211ENST00000561438 LINC00596Q86U02 117 aa6.8□□□□□ -1.32
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TMOD3-211ENST00000561438 CHST4Q8NCG5 386 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.8□□□□□ -1.32
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TMOD3-211ENST00000561438 GPX8Q8TED1 209 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
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TMOD3-211ENST00000561438 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
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TMOD3-211ENST00000561438 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 FAM25AB3EWG3 89 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 FAM25CB3EWG5 89 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 FAM25GB3EWG6 89 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 MGST3O14880 152 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 CSF3P09919 207 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 MMP9P14780 707 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 NDUFB7P17568 137 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 OMGP23515 440 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 PAX6P26367 422 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 KLRD1Q13241 179 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 FBLN7Q53RD9 439 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-211ENST00000561438 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.79□□□□□ -1.32
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