RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	CFHR4	Q92496	578 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	KCNK15	Q9H427	330 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	MGST3	O14880	152 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	IL1A	P01583	271 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	CSN2	P05814	226 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	LIPF	P07098	398 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	EFNB2	P52799	333 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	GRK1	Q15835	563 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	C17orf50	Q8WW18	174 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	R3HDM4	Q96D70	268 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	TM2D1	Q9BX74	207 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	CHST6	Q9GZX3	395 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222		A0A0B4J203	849 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	BPIFB3	P59826	476 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	CD69	Q07108	199 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	KLRD1	Q13241	179 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	LY6E	Q16553	131 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	HSPB6	O14558	160 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	TMEM127	O75204	238 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	SERPINB10	P48595	397 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	TMBIM6	P55061	237 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	P2RX3	P56373	397 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	EDDM3B	P56851	147 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	PAX5	Q02548	391 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	PLA2G7	Q13093	441 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	EDDM3A	Q14507	147 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	NICN1	Q9BSH3	213 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	RAB22A	Q9UL26	194 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222		A0A0A6YYD4	124 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222		H3BUI4	141 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	PDCD6	O75340	191 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	GLA	P06280	429 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	RAB6A	P20340	208 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	FUT3	P21217	361 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	KCNJ3	P48549	501 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	AES	Q08117	197 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	RAB12	Q6IQ22	244 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	PTX4	Q96A99	478 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	COQ2	Q96H96	371 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PQ09	198 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PRX2	142 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	FUOM	A2VDF0	154 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62

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