RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 IGLL1P15814 213 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 TMEM11P17152 192 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 YIF1BQ5BJH7 314 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 ATAD3CQ5T2N8 411 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 FOXB2Q5VYV0 432 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 DHRSXQ8N5I4 330 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 C5orf56Q8N8D9 126 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 ZFP41Q8N8Y5 198 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 OR52M1Q8NGK5 317 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 SGCDQ92629 289 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 FGF16O43320 207 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 IGKV1D-33P01593 117 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 IGKV1-33P01594 117 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 MT-ND4P03905 459 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 PF4V1P10720 104 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 GTF2F2P13984 249 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 FSTP19883 344 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 ST3GAL4Q11206 333 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 MED21Q13503 144 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 EBI3Q14213 229 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 HES1Q14469 280 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 HNF4GQ14541 408 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 SLC22A6Q4U2R8 563 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 LAIR2Q6ISS4 152 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 ZNF497Q6ZNH5 498 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 LINC00311Q8N616 119 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 PACRGLQ8N7B6 248 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 SETD9Q8NE22 299 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 OR10X1Q8NGY0 326 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 MRAPQ8TCY5 172 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 CCDC107Q8WV48 283 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 ARL11Q969Q4 196 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 C8orf4Q9NR00 106 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 A0A1W2PPK0 400 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 PSMB11A5LHX3 300 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 HSD17B6O14756 317 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 PIN1P1O15428 100 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 ORC5O43913 435 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 PF4P02776 101 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 LOXL3P58215 753 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 GPR176Q14439 515 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 LYPD6Q86Y78 171 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 UBALD1Q8TB05 177 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 MUL1Q969V5 352 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 GFOD1Q9NXC2 390 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
CS-229ENST00000551936 NOTCH3Q9UM47 2321 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 CCRL2O00421 344 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 IGHG2P01859 326 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 CD1AP06126 327 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 IGHV3-43DP0DP04 118 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 DOC2BQ14184 412 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 MOB3BQ86TA1 216 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 ZNF329Q86UD4 541 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 CDH26Q8IXH8 852 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 C8orf31Q8N9H6 132 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 NEK7Q8TDX7 302 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 OR14A2Q96R54 314 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 CKLFQ9UBR5 152 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 EFCAB10A6NFE3 127 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 AIPO00170 330 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 MAS1P04201 325 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 GNAO1P09471 354 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 CAPGP40121 348 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 REG1BP48304 166 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 TAS2R43P59537 309 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 SLC35A2P78381 396 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 Q3ZCU0 254 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 GAPTQ8N292 157 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 JAGN1Q8N5M9 183 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 Q8N6K4 173 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 CHPT1Q8WUD6 406 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 FBLIM1Q8WUP2 373 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 DERL3Q96Q80 235 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-229ENST00000551936 SPACA1Q9HBV2 294 aa11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms