RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		9.84	□□□□□ -0.83
LETMD1-231	ENST00000551931	C3orf84	H3BNL1	204 aa		9.83	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	C15orf65	H3BRN8	121 aa		9.83	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	MPZL2	O60487	215 aa		9.83	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	FCGR1A	P12314	374 aa		9.83	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	KCNJ3	P48549	501 aa		9.83	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	FHL3	Q13643	280 aa		9.83	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		9.83	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF529	Q6P280	563 aa		9.83	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	SATL1	Q86VE3	508 aa		9.83	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		9.83	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931		Q8NFD4	153 aa		9.83	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	9.83	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		9.83	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	LGALS12	Q96DT0	336 aa		9.83	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	9.83	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	GPER1	Q99527	375 aa		9.83	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	ALG8	Q9BVK2	526 aa		9.83	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	9.83	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		9.83	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	DHDH	Q9UQ10	334 aa		9.83	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		9.82	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM212	A6NML5	194 aa		9.82	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	CDRT1	O95170	752 aa		9.82	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	HTR3B	O95264	441 aa		9.82	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	IGHG4	P01861	327 aa		9.82	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	ELANE	P08246	267 aa		9.82	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		9.82	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	RAB3A	P20336	220 aa		9.82	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	GALE	Q14376	348 aa		9.82	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	RSU1	Q15404	277 aa		9.82	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		9.82	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		9.82	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	ASCL4	Q6XD76	172 aa		9.82	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		9.82	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	LINC00311	Q8N616	119 aa		9.82	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		9.82	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		9.82	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	S1PR3	Q99500	378 aa		9.82	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	GON7	Q9BXV9	100 aa		9.82	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		9.82	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		9.82	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC31A2	O15432	143 aa		9.81	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	MOS	P00540	346 aa		9.81	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	ALPL	P05186	524 aa		9.81	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	PSMB8	P28062	276 aa		9.81	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	CHAT	P28329	748 aa		9.81	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	CD1B	P29016	333 aa		9.81	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	SOX2	P48431	317 aa		9.81	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	F2RL1	P55085	397 aa		9.81	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		9.81	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		9.81	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	SYS1	Q8N2H4	156 aa		9.81	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	OR11H1	Q8NG94	326 aa		9.81	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		9.81	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		9.81	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC107	Q8WV48	283 aa		9.81	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	ARL11	Q969Q4	196 aa		9.81	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		9.81	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	IFT22	Q9H7X7	185 aa		9.81	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		9.81	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		9.81	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		9.8	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		9.8	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	MAGEB3	O15480	346 aa		9.8	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	GABRB1	P18505	474 aa		9.8	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	GZMH	P20718	246 aa		9.8	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	VDAC1	P21796	283 aa		9.8	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		9.8	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	CASC10	Q5T4H9	136 aa		9.8	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		9.8	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	KCTD7	Q96MP8	289 aa		9.8	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	JAM3	Q9BX67	310 aa		9.8	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	GNB4	Q9HAV0	340 aa		9.8	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		9.8	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A1W2PP11	408 aa		9.79	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	EI24	O14681	340 aa		9.79	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	LY86	O95711	162 aa		9.79	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	IGF1	P05019	195 aa		9.79	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	IL3RA	P26951	378 aa		9.79	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	SOX6	P35712	828 aa		9.79	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	VHL	P40337	213 aa		9.79	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF134	P52741	427 aa		9.79	□□□□□ -0.84
LETMD1-231	ENST00000551931	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms