RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
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PTPRB-209ENST00000550857 FLRT3Q9NZU0 649 aa6.96□□□□□ -1.3
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PTPRB-209ENST00000550857 KPTNQ9Y664 436 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 HPXP02790 462 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 LY6EQ16553 131 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 ANK1P16157 1881 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 A0A0B4J293 547 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.93□□□□□ -1.3
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