RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541434.5

CADM1-211, Transcript of cell adhesion molecule 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CADM1, Length 1,112 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1-211ENST00000541434 GDNFP39905 211 aa13.01□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 GLP1RP43220 463 aa13.01□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 C6orf183Q5T699 404 aa13.01□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 Q6ZS49 121 aa13.01□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 MOB1BQ7L9L4 216 aa13.01□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 C5orf24Q7Z6I8 188 aa13.01□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 LYSMD2Q8IV50 215 aa13.01□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa13.01□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 LY6G5BQ8NDX9 201 aa13.01□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 BEST4Q8NFU0 473 aa13.01□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 CCDC32Q9BV29 185 aa13.01□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 TAF9BQ9HBM6 251 aa13.01□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 ZNF286AQ9HBT8 521 aa13.01□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 ANAPC10Q9UM13 185 aa13.01□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa13□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 SCTP09683 121 aa13□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 GSTT2P0CG29 244 aa13□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 GSTT2BP0CG30 244 aa13□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 NAT1P18440 290 aa13□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 RCVRNP35243 200 aa13□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 KIR2DS4P43632 304 aa13□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 ACTBP60709 375 aa13□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 ACTG1P63261 375 aa13□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 ZNF273Q14593 569 aa13□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 KIR2DS1Q14954 304 aa13□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 OR52W1Q6IF63 320 aa13□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 TRAT1Q6PIZ9 186 aa13□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 TCF23Q7RTU1 214 aa13□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 ARL11Q969Q4 196 aa13□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 C1orf159Q96HA4 380 aa13□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 LPAR2Q9HBW0 351 aa13□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 MMP26Q9NRE1 261 aa13□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 TAS2R3Q9NYW6 316 aa13□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 OPN4Q9UHM6 478 aa13□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 ANXA10Q9UJ72 324 aa13□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 CSMD1Q96PZ7 3565 aa13□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 DSCAML1Q8TD84 2053 aa13□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 VPS13CQ709C8 3753 aa12.99□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa12.99□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 A0A1W2PPH5 198 aa12.99□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 B4DSR2 109 aa12.99□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 C12orf77C9JDV5 145 aa12.99□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 LIPFP07098 398 aa12.99□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 ZNF728P0DKX0 622 aa12.99□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 CCL3L1P16619 93 aa12.99□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 HLA-DMAP28067 261 aa12.99□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 PAX2Q02962 417 aa12.99□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 C17orf58Q2M2W7 97 aa12.99□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 CHRFAM7AQ494W8 412 aa12.99□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 TRIQKQ629K1 86 aa12.99□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 ZNF554Q86TJ5 538 aa12.99□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 PRR18Q8N4B5 295 aa12.99□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 TMEM229BQ8NBD8 167 aa12.99□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 RFESDQ8TAC1 157 aa12.99□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 UBALD1Q8TB05 177 aa12.99□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 SNAPC3Q92966 411 aa12.99□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 DMRTB1Q96MA1 342 aa12.99□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 ZNF714Q96N38 554 aa12.99□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 TAS2R8Q9NYW2 309 aa12.99□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 CALYQ9NYX4 217 aa12.99□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 C15orf65H3BRN8 121 aa12.98□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 FABP7O15540 132 aa12.98□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 SPINT2O43291 252 aa12.98□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 ENSAO43768 121 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 HBZP02008 142 aa12.98□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 CSF1P09603 554 aa12.98□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 IL7P13232 177 aa12.98□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 SSTR5P35346 364 aa12.98□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 INPP1P49441 399 aa12.98□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 DLX6P56179 175 aa12.98□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 HLA-DRB3P79483 266 aa12.98□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 HMGN3Q15651 99 aa12.98□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 TOMM5Q8N4H5 51 aa12.98□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 LINC01356Q8N9X3 169 aa12.98□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 OR1L1Q8NH94 360 aa12.98□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 TRIM63Q969Q1 353 aa12.98□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 GALMQ96C23 342 aa12.98□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa12.98□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 LINC00574Q9H8X3 128 aa12.98□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 RAB9BQ9NP90 201 aa12.98□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 ABCB10Q9NRK6 738 aa12.98□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 MYO9AB2RTY4 2548 aa12.97□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa12.97□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa12.97□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa12.97□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 PMP2P02689 132 aa12.97□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 MSMBP08118 114 aa12.97□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 TAS2R19P59542 299 aa12.97□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 ARPC4P59998 168 aa12.97□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 ERVFRD-1P60508 538 aa12.97□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 ARF6P62330 175 aa12.97□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 TMEM249Q2WGJ8 235 aa12.97□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 IGSF11Q5DX21 431 aa12.97□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CADM1-211ENST00000541434 BTNL3Q6UXE8 466 aa12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms