RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532474.5

RCN1-208, Transcript of reticulocalbin 1, human

TSL 3

Gene RCN1, Length 714 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCN1-208	ENST00000532474	CDH26	Q8IXH8	852 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	OR9G1	Q8NH87	305 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	CYGB	Q8WWM9	190 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	GHSR	Q92847	366 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	RPE	Q96AT9	228 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	OR4F4	Q96R69	305 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	METTL9	Q9H1A3	318 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	LY6L	H3BQJ8	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	HSPB6	O14558	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	GPX5	O75715	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	OR2F2	O95006	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	CDRT1	O95170	752 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	IL1A	P01583	271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	CD1A	P06126	327 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	CGB3	P0DN86	165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	CGB7	P0DN87	165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	BDKRB2	P30411	391 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	CAPG	P40121	348 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	GLP1R	P43220	463 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	OR3A4P	P47883	348 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	BLCAP	P62952	87 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	ST3GAL4	Q11206	333 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	MADCAM1	Q13477	382 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	MPV17L	Q2QL34	196 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	DDI2	Q5TDH0	399 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	XAF1	Q6GPH4	301 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	OSR2	Q8N2R0	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	STX19	Q8N4C7	294 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	MMP28	Q9H239	520 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	KIF25	Q9UIL4	384 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	ING4	Q9UNL4	249 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	NOTCH1	P46531	2555 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474		J3QR06	171 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	MYL12B	O14950	172 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	ORC5	O43913	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	CA11	O75493	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	CLIC3	O95833	236 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	SERPINA2	P20848	420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	NFYB	P25208	207 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	RAB7A	P51149	207 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	PIGY	Q3MUY2	71 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474		Q3ZCU0	254 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	OR8H3	Q8N146	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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