RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524384.5

PTP4A2-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase type IVA, member 2, human

TSL 5

Gene PTP4A2, Length 663 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTP4A2-208	ENST00000524384	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	RFESD	Q8TAC1	157 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	MS4A10	Q96PG2	267 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	MED20	Q9H944	212 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384		V9GYS6	101 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	MRAS	O14807	208 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	GADD45G	O95257	159 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	IFNA4	P05014	189 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	ZNF44	P15621	663 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	SMIM11A	P58511	58 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	NDP	Q00604	133 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	SCN1B	Q07699	218 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	TMEM177	Q53S58	311 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	FAHD1	Q6P587	224 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	RDH10	Q8IZV5	341 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	C7orf34	Q96L11	122 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	C8orf49	Q96NF6	230 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	CST11	Q9H112	138 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	HMG20A	Q9NP66	347 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	IL20	Q9NYY1	176 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	APLN	Q9ULZ1	77 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	GSTA4	O15217	222 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	TXNL1	O43396	289 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	CYB5A	P00167	134 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	IFNG	P01579	166 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	ZNF3	P17036	446 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	ALOX5AP	P20292	161 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	IL3RA	P26951	378 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	SSTR5	P35346	364 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	FUT6	P51993	359 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	DYRK1A	Q13627	763 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	UBE2V2	Q15819	145 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	GUCA2B	Q16661	112 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	DEFB135	Q30KP9	77 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	ACTBL2	Q562R1	376 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	COQ5	Q5HYK3	327 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	LIN54	Q6MZP7	749 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384		Q6ZWC4	215 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	LINC00311	Q8N616	119 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	CHST4	Q8NCG5	386 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	OTULIN	Q96BN8	352 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	MRO	Q9BYG7	248 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	FBXL17	Q9UF56	701 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	KIF25	Q9UIL4	384 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384		A0A1B0GTI1	187 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	C16orf90	A8MZG2	172 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	NBR2	O15453	112 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	E2F6	O75461	281 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	OR2A4	O95047	310 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	TRGV3	P03979	118 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	CD40LG	P29965	261 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	VHL	P40337	213 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	ALDH3A2	P51648	485 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	ACTB	P60709	375 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	VSNL1	P62760	191 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	LIPE	Q05469	1076 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	6.04	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	LSAMP	Q13449	338 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	TATDN3	Q17R31	274 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384		Q6P435	159 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PTP4A2-208	ENST00000524384	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		6.04	□□□□□ -1.44

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67 ms