RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 PRR4Q16378 134 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 MAJINQ3KP22 176 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF404Q494X3 552 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 CASC10Q5T4H9 136 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 C5orf46Q6UWT4 87 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 CCDC121Q6ZUS5 278 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 NDUFA11Q86Y39 141 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 SLC30A8Q8IWU4 369 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 TRIML2Q8N7C3 387 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 CLDN22Q8N7P3 220 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM185AQ8NFB2 350 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 OR56B2PQ8NGI1 322 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 OR5J2Q8NH18 312 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 OR6X1Q8NH79 312 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 MUC7Q8TAX7 377 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 ACMSDQ8TDX5 336 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 MCHR2Q969V1 340 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 SLC25A38Q96DW6 304 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 TEX37Q96LM6 180 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 CCDC115Q96NT0 180 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 OR52E6Q96RD3 313 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 OR2H1Q9GZK4 316 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 RERGLQ9H628 205 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 WDR76Q9H967 626 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 NANSQ9NR45 359 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 ZNRD1Q9P1U0 126 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 STARD10Q9Y365 291 aa2.46□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 WNK1Q9H4A3 2382 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 E9PBE3 544 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 H3BSA7 217 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 RFXANKO14593 260 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF861PO60384 105 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 TPST1O60507 370 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 HLA-DPB1P04440 258 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 IFNW1P05000 195 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 FGF4P08620 206 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 PGA4P0DJD7 388 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 PGA3P0DJD8 388 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 FUT1P19526 365 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 KITLGP21583 273 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 HTR2AP28223 471 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 CASQ1P31415 396 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 SERPINB5P36952 375 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 RAB25P57735 213 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 EMX2Q04743 252 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 FMODQ06828 376 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 CASP8Q14790 479 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 AGKQ53H12 422 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 OTPQ5XKR4 325 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 AP1ARQ63HQ0 302 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 ULK3Q6PHR2 472 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 COMTD1Q86VU5 262 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 C10orf111Q8N326 155 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 RNF148Q8N7C7 305 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 SDR9C7Q8NEX9 313 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 NOXO1Q8NFA2 376 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 OR8G5Q8NG78 346 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 OR51G2Q8NGK0 314 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 OR13G1Q8NGZ3 307 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 SLC7A13Q8TCU3 470 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 GIMAP1Q8WWP7 306 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 SLC7A6Q92536 515 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 THRSPQ92748 146 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 MAL2Q969L2 176 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 HAVCR1Q96D42 359 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 SLC41A3Q96GZ6 507 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 RBP7Q96R05 134 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF607Q96SK3 696 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 FMO2Q99518 471 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 ZBTB18Q99592 522 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 CCL13Q99616 98 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 MCHR1Q99705 422 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF649Q9BS31 505 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 NDUFAF3Q9BU61 184 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 TPPP3Q9BW30 176 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 SIAEQ9HAT2 523 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 INIPQ9NRY2 104 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM100Q9NV29 134 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 BTNL2Q9UIR0 455 aa2.45□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms