RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516553.1

RNU6-506P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 506, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-506P, Length 94 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-506P-201ENST00000516553 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 RAB20Q9NX57 234 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 MYOFQ9NZM1 2061 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 MYH11P35749 1972 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 TMEM250H0YL14 139 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 GATCO43716 136 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 DNAJB6O75190 326 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 CA2P00918 260 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 LTAP01374 205 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 OR8G3PP0DMU2 310 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 CCR7P32248 378 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 ZNF90Q03938 601 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 PSG3Q16557 428 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 ATP6V1FQ16864 119 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 DUPD1Q68J44 220 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 ULK3Q6PHR2 472 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 SLC35D2Q76EJ3 337 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 TRIML2Q8N7C3 387 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 Q96M85 177 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 POMPQ9Y244 141 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 RTTNQ86VV8 2226 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 ZNF532Q9HCE3 1301 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 PCDH15Q96QU1 1955 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 C1QCP02747 245 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 IVDP26440 423 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 CD200P41217 278 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 CSKP41240 450 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 NNATQ16517 81 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 OR51Q1Q8NH59 317 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 MUC5ACP98088 5654 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 C11orf86A6NJI1 115 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 H3BPC8 53 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 GOLGA8TH3BQL2 631 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 PLA2G10O15496 165 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 GNRH2O43555 120 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 LY6HO94772 140 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 SNX4O95219 450 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 LIPCP11150 499 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 ZNF3P17036 446 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 RPL14P50914 215 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 ERHP84090 104 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 NUMA1Q14980 2115 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 CLEC20AQ6ZU45 233 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 BBOF1Q8ND07 529 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 TM6SF2Q9BZW4 377 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 POLEQ07864 2286 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-506P-201ENST00000516553 TECTAO75443 2155 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 SCN9AQ15858 1988 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 J3QLI3 93 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 ATF1P18846 271 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 GABRA3P34903 492 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 AKR1C2P52895 323 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 IL18Q14116 193 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 C10orf107Q8IVU9 208 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 KATNAL2Q8IYT4 538 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 OR10A6Q8NH74 314 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 SUN5Q8TC36 379 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 POTEKPQ9BYX7 375 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 EXO5Q9H790 373 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 DIABLOQ9NR28 239 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 STK38LQ9Y2H1 464 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 MYO5BQ9ULV0 1848 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 LOC100653049A0A140TA62 436 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 SEC14L6B5MCN3 397 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 WRBO00258 174 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 KRT34O76011 436 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 SLC2A1P11166 492 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 RHOAP61586 193 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 BSPH1Q075Z2 132 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 SLC38A11Q08AI6 406 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 HES3Q5TGS1 186 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 ATPAF2Q8N5M1 289 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 GATD1Q8NB37 220 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 PROKR2Q8NFJ6 384 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 OR11H1Q8NG94 326 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 OR8B12Q8NGG6 310 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 CLHC1Q8NHS4 586 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 BIRC8Q96P09 236 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-506P-201ENST00000516553 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms