RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514654.5

ATP2C1-222, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, human

TSL 1 (best)

Gene ATP2C1, Length 4,730 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2C1-222	ENST00000514654	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	TEX30	Q5JUR7	227 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	R3HDM4	Q96D70	268 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	OOEP	A6NGQ2	149 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	PRR33	A8MZF0	331 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	PPP1R2P9	O14990	202 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	FABP1	P07148	127 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	ADRA2A	P08913	450 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	PSG2	P11465	335 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	HLA-DRB3	P79483	266 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	COL10A1	Q03692	680 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	RTP5	Q14D33	572 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	AP1S3	Q96PC3	154 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	CCL13	Q99616	98 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	GHITM	Q9H3K2	345 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	MED13L	Q71F56	2210 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	NUDT19	A8MXV4	375 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	CLN5	O75503	358 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZNF250	P15622	560 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	PRDX2	P32119	198 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	NPBWR2	P48146	333 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	RAB7A	P51149	207 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	ACSM6	Q6P461	480 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	RAB1C	Q92928	201 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	NTNG2	Q96CW9	530 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	RNF122	Q9H9V4	155 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	C7orf66	A4D0T2	115 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	ISG15	P05161	165 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	GZMH	P20718	246 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	IL13RA2	Q14627	380 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	GPR137	Q96N19	417 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	OR2V2	Q96R30	315 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		5.34	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	AHRR	A9YTQ3	701 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654		K7EQM0	130 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	GFRA3	O60609	400 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	CLDN14	O95500	239 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	S100A7	P31151	101 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	PTX4	Q96A99	478 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	TMEM56	Q96MV1	263 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	CREBBP	Q92793	2442 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	GYPA	P02724	150 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	CSN1S1	P47710	185 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	BPIFB3	P59826	476 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	FAM3A	P98173	230 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	P2RY6	Q15077	328 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZNF429	Q86V71	674 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	OR2H2	O95918	312 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	TNXA	Q16473	311 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	CSRP2	Q16527	193 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		5.33	□□□□□ -1.56
ATP2C1-222	ENST00000514654	OR4S2	Q8NH73	311 aa		5.33	□□□□□ -1.56

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