RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, human

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGGT1B-205	ENST00000514178	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	WDR54	Q9H977	334 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	CD300LB	A8K4G0	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178		C9J4A7	227 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178		I3L4J1	428 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	ITGB1BP1	O14713	200 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	RAB36	O95755	333 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	IMPA1	P29218	277 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	LINC00315	P59091	139 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	KRTAP12-2	P59991	146 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	MED27	Q6P2C8	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	ZNF709	Q8N972	641 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	TMEM56	Q96MV1	263 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	ING2	Q9H160	280 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	RHOF	Q9HBH0	211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	TAC3	Q9UHF0	121 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	SLIT3	O75094	1523 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	CACNA1A	O00555	2505 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	CLTCL1	P53675	1640 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	TMEM150B	A6NC51	233 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	ENTPD6	O75354	484 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	ADAP1	O75689	374 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	CXorf1	O96002	111 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	IGKV3-11	P04433	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	PET100	P0DJ07	73 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	RAB8A	P61006	207 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	MOBP	Q13875	183 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	GLYAT	Q6IB77	296 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	ZNF773	Q6PK81	442 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	ATP7B	P35670	1465 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	CA2	P00918	260 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	SPN	P16150	400 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	SLC6A1	P30531	599 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	STC1	P52823	247 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	RAB25	P57735	213 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	THTPA	Q9BU02	230 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	FBXL15	Q9H469	300 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	SBF2	Q86WG5	1849 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PGGT1B-205	ENST00000514178	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PGGT1B-205	ENST00000514178	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PGGT1B-205	ENST00000514178	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PGGT1B-205	ENST00000514178	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PGGT1B-205	ENST00000514178	FUT5	Q11128	374 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PGGT1B-205	ENST00000514178	LFNG	Q8NES3	379 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PGGT1B-205	ENST00000514178	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PGGT1B-205	ENST00000514178	DDI1	Q8WTU0	396 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PGGT1B-205	ENST00000514178	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PGGT1B-205	ENST00000514178	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PGGT1B-205	ENST00000514178	LINC00477	Q96M19	166 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PGGT1B-205	ENST00000514178	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PGGT1B-205	ENST00000514178	PIK3C2G	O75747	1445 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PGGT1B-205	ENST00000514178	PPL	O60437	1756 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PGGT1B-205	ENST00000514178	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PGGT1B-205	ENST00000514178	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PGGT1B-205	ENST00000514178	RAD50	Q92878	1312 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PGGT1B-205	ENST00000514178	FAM183A	A6NL82	134 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PGGT1B-205	ENST00000514178	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PGGT1B-205	ENST00000514178	SYNGR1	O43759	233 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PGGT1B-205	ENST00000514178	SOD3	P08294	240 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PGGT1B-205	ENST00000514178	ZNF286B	P0CG31	522 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PGGT1B-205	ENST00000514178	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PGGT1B-205	ENST00000514178	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PGGT1B-205	ENST00000514178	MPV17	P39210	176 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PGGT1B-205	ENST00000514178	PSMD7	P51665	324 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PGGT1B-205	ENST00000514178	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.51	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms