RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC35A1P78382 337 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 CRADDP78560 199 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 KLRB1Q12918 225 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 CDKN3Q16667 212 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 HLA-DRB5Q30154 266 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 OR10K2Q6IF99 312 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF343Q6P1L6 599 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 SEM1Q6ZVN7 128 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 LRP11Q86VZ4 500 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 ABHD12Q8N2K0 398 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 OR1J1Q8NGS3 322 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 FGF13Q92913 245 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 CDIP1Q9H305 208 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 RERGLQ9H628 205 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 HES4Q9HCC6 221 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF222Q9UK12 451 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 LOXL2Q9Y4K0 774 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 ORC6Q9Y5N6 252 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 USP34Q70CQ2 3546 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A1W2PQJ5 194 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 MFNGO00587 321 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 NKX2-8O15522 239 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 PRAMEF10O60809 474 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 CDRT1O95170 752 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 SBK3P0C264 359 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 ZGLP1P0C6A0 271 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 PVRP15151 417 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 ATF1P18846 271 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 CDK2P24941 298 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 HRH1P35367 487 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 GLRXP35754 106 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 NBL1P41271 181 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 EMP1P54849 157 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 XGP55808 180 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM53BQ14153 422 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM236Q5W0B7 351 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 HEPN1Q6WQI6 88 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 CLEC20AQ6ZU45 233 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 MRGPRGQ86SM5 289 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 MOB3BQ86TA1 216 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 LRRTM1Q86UE6 522 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 OR4B1Q8NGF8 309 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 OR2K2Q8NGT1 345 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 RDH11Q8TC12 318 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 MZB1Q8WU39 189 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 RNF183Q96D59 192 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 TRIB3Q96RU7 358 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 ATP5SQ99766 215 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 OR2D2Q9H210 308 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 SH2D2AQ9NP31 389 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 H7BYZ3 331 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 MPDU1O75352 247 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 CSN3P07498 182 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 CT45A10P0DMU9 189 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 LYL1P12980 280 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 MGMTP16455 207 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 GRPRP30550 384 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 LEPP41159 167 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 OR3A2P47893 321 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 GRB2P62993 217 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 CD164Q04900 197 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 C1orf61Q13536 156 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 IL13RA2Q14627 380 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM78AQ5JUQ0 283 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF549Q6P9A3 640 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 PARM1Q6UWI2 310 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 APOOLQ6UXV4 268 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 GATD1Q8NB37 220 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF740Q8NDX6 193 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 OR1J4Q8NGS1 313 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 BLNKQ8WV28 456 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 FGF14Q92915 247 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms