RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493752.5

ABCD4-216, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 3

Gene ABCD4, Length 719 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-216ENST00000493752 OR4K15Q8NH41 348 aa6.67□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 MRGPRDQ8TDS7 321 aa6.67□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 CCDC107Q8WV48 283 aa6.67□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 TNFRSF14Q92956 283 aa6.67□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.67□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 BEX2Q9BXY8 128 aa6.67□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa6.67□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 RAB9BQ9NP90 201 aa6.67□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 BATF3Q9NR55 127 aa6.67□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.67□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.67□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.67□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 A3GALT2U3KPV4 340 aa6.67□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.67□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 CR1P17927 2039 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 TRAV39A0A0B4J263 110 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 INAFM1C9JVW0 142 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 CTDSP2O14595 271 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 SPINT2O43291 252 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 HPGDSO60760 199 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 CLPXO76031 633 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 FSHBP01225 129 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 CD3GP09693 182 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 IGHV1-8P0DP01 117 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 GLP1RP43220 463 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 ARFRP1Q13795 201 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 OLFML2AQ68BL7 652 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF880Q6PDB4 577 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 MOB1BQ7L9L4 216 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 RTN4RL2Q86UN3 420 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 MCFD2Q8NI22 146 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 ARL11Q969Q4 196 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 CYYR1Q96J86 154 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 MMP27Q9H306 513 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 Q9N2K0 584 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 CALYQ9NYX4 217 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 NUP50Q9UKX7 468 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 SESN1Q9Y6P5 492 aa6.66□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.344e-15■■■■■ 30.4
ABCD4-216ENST00000493752 A0A087X0M5 115 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 A0A1B0GX30 115 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 FAM25AB3EWG3 89 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 FAM25CB3EWG5 89 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 FAM25GB3EWG6 89 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 C12orf77C9JDV5 145 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 C15orf65H3BRN8 121 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 F2RL2O00254 374 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 RGS5O15539 181 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 CRLF1O75462 422 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 HLA-DQB1P01920 261 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 DTYMKP23919 212 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 FPR2P25090 351 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 TALDO1P37837 337 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 MNDAP41218 407 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 UBE2E1P51965 193 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 RIPPLY3P57055 190 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 GUCA2AQ02747 115 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 CHRFAM7AQ494W8 412 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 GPR157Q5UAW9 335 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 RFESDQ8TAC1 157 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 LHX4Q969G2 390 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 MIXL1Q9H2W2 232 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 TAF9BQ9HBM6 251 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.65□□□□□ -1.34
ABCD4-216ENST00000493752 ABCA2Q9BZC7 2435 aa6.65□□□□□ -1.35
ABCD4-216ENST00000493752 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ABCD4-216ENST00000493752 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.64□□□□□ -1.35
ABCD4-216ENST00000493752 TMEM235A6NFC5 223 aa6.64□□□□□ -1.35
ABCD4-216ENST00000493752 TRDCB7Z8K6 153 aa6.64□□□□□ -1.35
ABCD4-216ENST00000493752 MMP23AO75900 390 aa6.64□□□□□ -1.35
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