RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492728.1

CHD1L-209, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 1 like, humanhuman

TSL 2

Gene CHD1L, Length 662 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1L-209ENST00000492728 OR4X2Q8NGF9 303 aa14.61□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa14.61□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa14.6□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa14.6□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa14.6□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 M0QZK8 103 aa14.6□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 EBAG9O00559 213 aa14.6□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 IGKV1D-33P01593 117 aa14.6□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 IGKV1-33P01594 117 aa14.6□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 TMEM11P17152 192 aa14.6□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 MYL12AP19105 171 aa14.6□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 REG1BP48304 166 aa14.6□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 SLC22A6Q4U2R8 563 aa14.6□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa14.6□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 OR10A7Q8NGE5 316 aa14.6□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 CCDC107Q8WV48 283 aa14.6□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 GGHQ92820 318 aa14.6□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 LINC00527Q9UJ94 153 aa14.6□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 A0A1W2PPK0 400 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 HSD17B6O14756 317 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 SLC31A2O15432 143 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 GPX5O75715 221 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 PF4P02776 101 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 CSTBP04080 98 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 GNAO1P09471 354 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 IGHV3-43DP0DP04 118 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 FSTP19883 344 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 RAB7AP51149 207 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 LOXL3P58215 753 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 HES1Q14469 280 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 MPV17LQ2QL34 196 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 Q499Y3 187 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 ATAD3CQ5T2N8 411 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF497Q6ZNH5 498 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 LYPD6Q86Y78 171 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 OR8H3Q8N146 312 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 OR10X1Q8NGY0 326 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 MUL1Q969V5 352 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 TMEM80Q96HE8 168 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 OR14A2Q96R54 314 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 DNAH9Q9NYC9 4486 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa14.58□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 IRGMA1A4Y4 181 aa14.58□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 PSMB11A5LHX3 300 aa14.58□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 LINC01548A6NM66 108 aa14.58□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 MT-ND4P03905 459 aa14.58□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 KRTAP10-11P60412 298 aa14.58□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 YIF1BQ5BJH7 314 aa14.58□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa14.58□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 LINC00596Q86U02 117 aa14.58□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 Q8N6K4 173 aa14.58□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 ARL11Q969Q4 196 aa14.58□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 GFOD1Q9NXC2 390 aa14.58□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 GTF2F2P13984 249 aa14.57□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 ST3GAL4Q11206 333 aa14.57□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 TTC23Q5W5X9 447 aa14.57□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 LINC00311Q8N616 119 aa14.57□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 LINC00482Q8N8I6 264 aa14.57□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa14.57□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 DERL3Q96Q80 235 aa14.57□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 C12orf77C9JDV5 145 aa14.56□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 K7EIL1 84 aa14.56□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 AIPO00170 330 aa14.56□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 CCRL2O00421 344 aa14.56□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 FGF16O43320 207 aa14.56□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 GZMHP20718 246 aa14.56□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 VHLP40337 213 aa14.56□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 EBI3Q14213 229 aa14.56□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 RCN1Q15293 331 aa14.56□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa14.56□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 C5orf24Q7Z6I8 188 aa14.56□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 IZUMO1Q8IYV9 350 aa14.56□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 JAGN1Q8N5M9 183 aa14.56□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF439Q8NDP4 499 aa14.56□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 TMEM104Q8NE00 496 aa14.56□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 SETD9Q8NE22 299 aa14.56□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 OR52M1Q8NGK5 317 aa14.56□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 NEK7Q8TDX7 302 aa14.56□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 S100A13Q99584 98 aa14.56□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 BANF2Q9H503 90 aa14.56□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 MPIG6BO95866 241 aa14.55□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 IGHG2P01859 326 aa14.55□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 MAS1P04201 325 aa14.55□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 SLC35A2P78381 396 aa14.55□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 SIGIRRQ6IA17 410 aa14.55□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 OR2W3Q7Z3T1 314 aa14.55□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 MOB3BQ86TA1 216 aa14.55□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 DHRSXQ8N5I4 330 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms