RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491240.5

RBM3-211, Transcript of RNA binding motif protein 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM3, Length 951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM3-211ENST00000491240 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
RBM3-211ENST00000491240 HSD17B6O14756 317 aa12.9□□□□□ -0.34
RBM3-211ENST00000491240 RIPK1Q13546 671 aa12.9□□□□□ -0.34
RBM3-211ENST00000491240 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa12.9□□□□□ -0.34
RBM3-211ENST00000491240 C8orf86Q6ZUL3 223 aa12.9□□□□□ -0.34
RBM3-211ENST00000491240 Q8NFD4 153 aa12.9□□□□□ -0.34
RBM3-211ENST00000491240 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa12.9□□□□□ -0.34
RBM3-211ENST00000491240 DUX3Q96PT4 197 aa12.9□□□□□ -0.34
RBM3-211ENST00000491240 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
RBM3-211ENST00000491240 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa12.9□□□□□ -0.34
RBM3-211ENST00000491240 ZNF281Q9Y2X9 895 aa12.9□□□□□ -0.34
RBM3-211ENST00000491240 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa12.89□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa12.89□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 NUDT19A8MXV4 375 aa12.89□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 CCRL2O00421 344 aa12.89□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 SLC31A2O15432 143 aa12.89□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 MYL12AP19105 171 aa12.89□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 DCKP27707 260 aa12.89□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 KCNJ3P48549 501 aa12.89□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 RAB7AP51149 207 aa12.89□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 CCDC58Q4VC31 144 aa12.89□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 ETV3LQ6ZN32 361 aa12.89□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 C10orf67Q8IYJ2 551 aa12.89□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 GHSRQ92847 366 aa12.89□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 MUL1Q969V5 352 aa12.89□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 SMIM19Q96E16 107 aa12.89□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa12.89□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 LINC00574Q9H8X3 128 aa12.89□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 BABAM2Q9NXR7 383 aa12.89□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa12.88□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 C15orf65H3BRN8 121 aa12.88□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 OGG1O15527 345 aa12.88□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 VHLP40337 213 aa12.88□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 LCNL1Q6ZST4 164 aa12.88□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 SLC35E3Q7Z769 313 aa12.88□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 OR8H3Q8N146 312 aa12.88□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 PRR18Q8N4B5 295 aa12.88□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 JAGN1Q8N5M9 183 aa12.88□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 LINC00482Q8N8I6 264 aa12.88□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa12.88□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 OR10V1Q8NGI7 309 aa12.88□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 OR4K15Q8NH41 348 aa12.88□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 BANF2Q9H503 90 aa12.88□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 AIPO00170 330 aa12.87□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 MAS1P04201 325 aa12.87□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 OR2W3Q7Z3T1 314 aa12.87□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 C5orf24Q7Z6I8 188 aa12.87□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 OR10A7Q8NGE5 316 aa12.87□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 OR14A2Q96R54 314 aa12.87□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 GFOD1Q9NXC2 390 aa12.87□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 IL36GQ9NZH8 169 aa12.87□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 DNAH3Q8TD57 4116 aa12.87□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa12.86□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 MT-ND4P03905 459 aa12.86□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 GTF2F2P13984 249 aa12.86□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 GZMHP20718 246 aa12.86□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 RAB25P57735 213 aa12.86□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP12.86□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 PAX5Q02548 391 aa12.86□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 Q499Y3 187 aa12.86□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 NHLRC3Q5JS37 347 aa12.86□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 C11orf87Q6NUJ2 197 aa12.86□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa12.86□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 CHPT1Q8WUD6 406 aa12.86□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 GGHQ92820 318 aa12.86□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 TMEM80Q96HE8 168 aa12.86□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 IFT22Q9H7X7 185 aa12.86□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa12.86□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 IRGMA1A4Y4 181 aa12.85□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 C12orf77C9JDV5 145 aa12.85□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 EBAG9O00559 213 aa12.85□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 FGF16O43320 207 aa12.85□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 THBS3P49746 956 aa12.85□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 SLC35B1P78383 322 aa12.85□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 DOC2BQ14184 412 aa12.85□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 MPV17LQ2QL34 196 aa12.85□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 AWAT2Q6E213 333 aa12.85□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 ZNF497Q6ZNH5 498 aa12.85□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa12.85□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 FOXRED2Q8IWF2 684 aa12.85□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 STPG2Q8N412 459 aa12.85□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 STX19Q8N4C7 294 aa12.85□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 OR51D1Q8NGF3 324 aa12.85□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 OR1L1Q8NH94 360 aa12.85□□□□□ -0.35
RBM3-211ENST00000491240 PGLYRP3Q96LB9 341 aa12.85□□□□□ -0.35
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