RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490051.1

GRB10-222, Transcript of growth factor receptor bound protein 10, human

TSL 4

Gene GRB10, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRB10-222	ENST00000490051	IGHG2	P01859	326 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GRB10-222	ENST00000490051	MYCNOS	P40205	109 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GRB10-222	ENST00000490051	GPR12	P47775	334 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GRB10-222	ENST00000490051	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
GRB10-222	ENST00000490051	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GRB10-222	ENST00000490051	DDI2	Q5TDH0	399 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GRB10-222	ENST00000490051	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GRB10-222	ENST00000490051	APH1B	Q8WW43	257 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GRB10-222	ENST00000490051	TMEM106A	Q96A25	262 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GRB10-222	ENST00000490051	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GRB10-222	ENST00000490051	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GRB10-222	ENST00000490051	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GRB10-222	ENST00000490051	ING4	Q9UNL4	249 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GRB10-222	ENST00000490051	DYNC1I1	O14576	645 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	LIMS3	P0CW19	117 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	LIMS4	P0CW20	117 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	ZNF529	Q6P280	563 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	PRR18	Q8N4B5	295 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051		Q8N9W7	124 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	ARL11	Q969Q4	196 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	C15orf65	H3BRN8	121 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	CCL24	O00175	119 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	AP4M1	O00189	453 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	MYF6	P23409	242 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	DGCR2	P98153	550 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051		Q8N6K4	173 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	OR52N1	Q8NH53	320 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	SLC29A1	Q99808	456 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	METTL9	Q9H1A3	318 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	ZFP57	Q9NU63	452 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	AIP	O00170	330 aa		10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	ATP5H	O75947	161 aa		10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	LALBA	P00709	142 aa		10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	CD2	P06729	351 aa		10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	KCNJ3	P48549	501 aa		10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	ETV1	P50549	477 aa		10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	PPP3R1	P63098	170 aa		10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	PAX5	Q02548	391 aa		10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	RAB40B	Q12829	278 aa		10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	GPR50	Q13585	617 aa		10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	TEX38	Q6PEX7	206 aa		10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	TMEM104	Q8NE00	496 aa		10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	GPR148	Q8TDV2	347 aa		10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	S100A13	Q99584	98 aa		10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	ASCL2	Q99929	193 aa		10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	ABCG5	Q9H222	651 aa		10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		10	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	RYR2	Q92736	4967 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	C12orf77	C9JDV5	145 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	MPZL2	O60487	215 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	BDKRB2	P30411	391 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	ECI1	P42126	302 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	F2RL1	P55085	397 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	EBI3	Q14213	229 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	ASCL4	Q6XD76	172 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	COMMD1	Q8N668	190 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051		Q8NFD4	153 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	OR8U1	Q8NH10	309 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	OR4K15	Q8NH41	348 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	OR1L1	Q8NH94	360 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051		Q96MT0	163 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	S1PR3	Q99500	378 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GRB10-222	ENST00000490051	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		9.99	□□□□□ -0.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms