RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 TRAV27A0A087WT01 109 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SERINC4A6NH21 518 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 NPIPB13A6NJU9 1138 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 B4DEV8 164 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 NPIPB4C9JG80 1138 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 UPK3AO75631 287 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 KNG1P01042 644 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 RPL12P30050 165 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SLC25A1P53007 311 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 RIPPLY3P57055 190 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZNF117Q03924 483 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 CD226Q15762 336 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZNF627Q7L945 461 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 NOXO1Q8NFA2 376 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TVP23CQ96ET8 276 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SLC35E1Q96K37 410 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 HES7Q9BYE0 225 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OR4C45A6NMZ5 311 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 FTCDNL1E5RQL4 147 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 NPIPA2E9PIF3 369 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OR6A2O95222 327 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TACSTD2P09758 323 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 CCKARP32238 428 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 MMP16P51512 607 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 LY6DQ14210 128 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ARL6IP1Q15041 203 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 FAM219AQ8IW50 185 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OR52E2Q8NGJ4 325 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OR51L1Q8NGJ5 315 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OR4C3Q8NH37 302 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OR4X1Q8NH49 305 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 GPR146Q96CH1 333 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OR10C1Q96KK4 312 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 GINS3Q9BRX5 216 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 AKAP9Q99996 3911 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 HEATR5AQ86XA9 2040 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PCNX3Q9H6A9 2034 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 KALRNO60229 2985 aa6.61□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PPP5D1E7EU14 171 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 E9PLN8 166 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 EFNA2O43921 213 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 WDR1O75083 606 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SFT2D2O95562 160 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 RFPL3SP0C7P2 107 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SLC6A6P31641 620 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 FCGR2CP31995 323 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 MC5RP33032 325 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 GABRA3P34903 492 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ARG2P78540 354 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PMPCAQ10713 525 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZNF429Q86V71 674 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OR51A7Q8NH64 312 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZNRF4Q8WWF5 429 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TMEM106AQ96A25 262 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 CMBLQ96DG6 245 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 RARRES2Q99969 163 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OR11A1Q9GZK7 315 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 FAM215AQ9Y5M1 114 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 H0YL77 283 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 CGAP01215 116 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 FHITP49789 147 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 HOGA1Q86XE5 327 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZNF679Q8IYX0 411 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 CHRM2P08172 466 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 NPIPA8P0DM63 369 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 FPR2P25090 351 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 FHL1Q13642 323 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 AQP3Q92482 292 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 NAGKQ9UJ70 344 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 RAB22AQ9UL26 194 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 MEMO1Q9Y316 297 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 NCOR2Q9Y618 2525 aa6.6□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 CACNA1GO43497 2377 aa6.6□□□□□ -1.35
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