RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469717.5

TPM3-215, Transcript of tropomyosin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TPM3, Length 4,041 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3-215ENST00000469717 ZNF318Q5VUA4 2279 aa6.87□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 FRG2CA6NGY1 282 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 C3orf80F5H4A9 247 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 TSPAN2O60636 221 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 LINC00614P0C842 121 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 UCP3P55916 312 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 NOXO1Q8NFA2 376 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 SDSLQ96GA7 329 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 PGAM5Q96HS1 289 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 RBKSQ9H477 322 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 CHST1O43916 411 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 PITX3O75364 302 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 IGKV3-11P04433 115 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 IFI6P09912 130 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 CD81P60033 236 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 EXT1Q16394 746 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 ZNF787Q6DD87 383 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 ZNF774Q6NX45 483 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 SLC46A1Q96NT5 459 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 GTF3C1Q12789 2109 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 ITGB1BP1O14713 200 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 TK1P04183 234 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 DAP3P51398 398 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 CLRN1P58418 232 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 VAMP2P63027 116 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 CST9LP1Q5W188 147 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 Q96M66 194 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 DECR2Q9NUI1 292 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 DKKL1Q9UK85 242 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa6.86□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 LRRC3CA6NJW4 275 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 BCL2P10415 239 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 OR1D5P58170 312 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 MYBPHQ13203 477 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 SLC16A14Q7RTX9 510 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 A0A0G2JRQ6 117 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 PI4KAP42356 2102 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 OR3A1P47881 315 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 MTCP1P56278 107 aa6.85□□□□□ -1.31
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TPM3-215ENST00000469717 TESK1Q15569 626 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 SPEM1Q8N4L4 309 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 IL22RA2Q969J5 263 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.85□□□□□ -1.31
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TPM3-215ENST00000469717 EML6Q6ZMW3 1958 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 DOCK7Q96N67 2140 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 HSPB6O14558 160 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 NSDHLQ15738 373 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 WDR73Q6P4I2 378 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 Q6ZVH6 145 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 ZNF100Q8IYN0 542 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 CACNA1DQ01668 2161 aa6.85□□□□□ -1.31
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TPM3-215ENST00000469717 TMEM150CB9EJG8 249 aa6.85□□□□□ -1.31
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TPM3-215ENST00000469717 DUX1O43812 170 aa6.85□□□□□ -1.31
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TPM3-215ENST00000469717 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.85□□□□□ -1.31
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TPM3-215ENST00000469717 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 MYOTQ9UBF9 498 aa6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.84□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 ZNF732B4DXR9 585 aa6.84□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 PPP5D1E7EU14 171 aa6.84□□□□□ -1.31
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