RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460731.5

PTPN12-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 12, human

TSL 2

Gene PTPN12, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN12-209	ENST00000460731	ADAM20	O43506	726 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	XRCC3	O43542	346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	NDUFB3	O43676	98 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	PDCD6	O75340	191 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	FOXH1	O75593	365 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	HLA-DQB1	P01920	261 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	RBP4	P02753	201 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	MT-ND4	P03905	459 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	SERPINA2	P20848	420 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	GATA3	P23771	443 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	DUSP1	P28562	367 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	PITPNB	P48739	271 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	GZMK	P49863	264 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	DLX6	P56179	175 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	ARL6IP1	Q15041	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	IDNK	Q5T6J7	187 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731		Q6ZS49	121 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	AP3S1	Q92572	193 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	COQ2	Q96H96	371 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	C18orf12	Q96KH6	178 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	WDFY2	Q96P53	400 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	OR8B2	Q96RD0	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	NICN1	Q9BSH3	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	DUX4	Q9UBX2	424 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	OPN4	Q9UHM6	478 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	NF1	P21359	2839 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	FUOM	A2VDF0	154 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	SMIM30	A4D0T7	59 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	C17orf98	A8MV24	154 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731		H7C1Q1	480 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731		J3QLI3	93 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	CTDSP2	O14595	271 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	DIRAS3	O95661	229 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	TFF1	P04155	84 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	HEXA	P06865	529 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	MSMB	P08118	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	SELL	P14151	372 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	MMP9	P14780	707 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	ELK1	P19419	428 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	GZMH	P20718	246 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	SOX6	P35712	828 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	ETV6	P41212	452 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	GABRA2	P47869	451 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	P2RX3	P56373	397 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	CARTPT	Q16568	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	ESCO2	Q56NI9	601 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	HACD4	Q5VWC8	232 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN12-209	ENST00000460731	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67

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