RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448188.1

SNORD57-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 57, humanhuman

BASIC

Gene SNORD57, Length 72 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD57-201ENST00000448188 NEMFO60524 1076 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 BCE1O60756 84 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 TDP2O95551 362 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 GOT1P17174 413 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 VDAC1P21796 283 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 CCR1P32246 355 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 MSH2P43246 934 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 ACADSBP45954 432 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 GPR1P46091 355 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 OMPP47874 163 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 SLC1A6P48664 564 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 TDO2P48775 406 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 CAMLGP49069 296 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 NPY4RP50391 375 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 DYNLT3P51808 116 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 CAPZA1P52907 286 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 OR4D2P58180 307 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 OR12D2P58182 307 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 AESQ08117 197 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 GOLGA8FQ08AF8 430 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 FUT5Q11128 374 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 PTPN20Q4JDL3 420 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 PYCR3Q53H96 274 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 CYBRD1Q53TN4 286 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF805Q5CZA5 627 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 OR2B11Q5JQS5 317 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 TIMM23BQ5SRD1 257 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 C6orf141Q5SZD1 244 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 NKAIN2Q5VXU1 208 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 LAIR2Q6ISS4 152 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 CDC73Q6P1J9 531 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 RTL4Q6ZR62 310 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 FA2HQ7L5A8 372 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 SLC35E3Q7Z769 313 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 ZFP82Q8N141 532 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 CCDC54Q8NEL0 328 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 SPATA4Q8NEY3 305 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 OR10Z1Q8NGY1 313 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 OR52E5Q8NH55 327 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 OR2AE1Q8NHA4 323 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 UCMAQ8WVF2 138 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 NT5C3BQ969T7 300 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 MTERF3Q96E29 417 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 L3HYPDHQ96EM0 354 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 SPACA5Q96QH8 159 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 AMELXQ99217 191 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 NPY6RQ99463 290 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 VAT1Q99536 393 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 GGACTQ9BVM4 153 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 RTL8AQ9BWD3 113 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 GNB1LQ9BYB4 327 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 TTTY12Q9BZ98 90 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 ACPTQ9BZG2 426 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 MIS12Q9H081 205 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 ASB7Q9H672 318 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 RGS18Q9NS28 235 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 SPHK1Q9NYA1 384 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 ERVK-18Q9QC07 812 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 GCC2Q8IWJ2 1684 aa-1.29□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 TRGV2A0A075B6R0 118 aa-1.3□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa-1.3□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 OR2A25A4D2G3 310 aa-1.3□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 OR6C74A6NCV1 312 aa-1.3□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 PGPA6NDG6 321 aa-1.3□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 OR4C46A6NHA9 309 aa-1.3□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 FAM159BA6NKW6 160 aa-1.3□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 YJEFN3A6XGL0 299 aa-1.3□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 LEUTXA8MZ59 168 aa-1.3□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 CENPBD1B2RD01 187 aa-1.3□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 GPR89AB7ZAQ6 455 aa-1.3□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 G3V3Y1 287 aa-1.3□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 H7C0S8 307 aa-1.3□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 M0QZ92 97 aa-1.3□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 HCRTR1O43613 425 aa-1.3□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 ATP6AP2O75787 350 aa-1.3□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 LDHAP00338 332 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 IFNB1P01574 187 aa-1.3□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 IGHV1-46P01743 117 aa-1.3□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 IGHV3-9P01782 118 aa-1.3□□□□□ -2.62
SNORD57-201ENST00000448188 HBE1P02100 147 aa-1.3□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms