RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
PTPA-222	ENST00000445241	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	BTBD17	A6NE02	478 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	VGLL3	A8MV65	326 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	ARG1	P05089	322 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	COX7A1	P24310	79 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	PRRX1	P54821	245 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	OR10A3	P58181	314 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	HES5	Q5TA89	166 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	C16orf87	Q6PH81	154 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	AJUBA	Q96IF1	538 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	KIRREL1	Q96J84	757 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	ING3	Q9NXR8	418 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	AIRE	O43918	545 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	MMP23A	O75900	390 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	SCGN	O76038	276 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	IGLV1-47	P01700	117 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	SDC2	P34741	201 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	DYNLT3	P51808	116 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	DYRK2	Q92630	601 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	MDFI	Q99750	246 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	NICN1	Q9BSH3	213 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PRD5	423 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PRF3	423 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PRM7	423 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	OOSP1	A8MZH6	123 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	C15orf65	H3BRN8	121 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	F2RL2	O00254	374 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	SPINT2	O43291	252 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	SMIM18	P0DKX4	95 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	HTR1D	P28221	377 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	CEACAM3	P40198	252 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	CLDN12	P56749	244 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	ARL6IP1	Q15041	203 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	BRICD5	Q6PL45	260 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	OR9G1	Q8NH87	305 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	ARL11	Q969Q4	196 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	CENPO	Q9BU64	300 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	KCNK15	Q9H427	330 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241		A0A0A6YYD4	124 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	UBE2QL1	A1L167	161 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	TOR1A	O14656	332 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	NAPSA	O96009	420 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	OMG	P23515	440 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	SSTR5	P35346	364 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	ARHGDIB	P52566	201 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241		Q6ZTK2	550 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	DPM3	Q9P2X0	92 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	ETV7	Q9Y603	341 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM89	A2RUT3	159 aa		11.85	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	SERPINE3	A8MV23	424 aa		11.85	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	LEUTX	A8MZ59	168 aa		11.85	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	SOCS1	O15524	211 aa		11.85	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	HKR1	P10072	659 aa		11.85	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	NFYB	P25208	207 aa		11.85	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	GDNF	P39905	211 aa		11.85	□□□□□ -0.51
PTPA-222	ENST00000445241	VEGFC	P49767	419 aa		11.85	□□□□□ -0.51

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