RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 ZDHHC16Q969W1 377 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 GDF15Q99988 308 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 SCN4AP35499 1836 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 TIAF1O95411 115 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 PRRX1P54821 245 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 LINC01590Q5TEZ4 76 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 ADTRPQ96IZ2 230 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 ATP5SQ99766 215 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 TOLLIPQ9H0E2 274 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 LHFPL6Q9Y693 200 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1W2PN81 502 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 FCGR3AP08637 254 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 HLA-GP17693 338 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 G6PCP35575 357 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 GALR1P47211 349 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 OR1K1Q8NGR3 316 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 SSMEM1Q8WWF3 244 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 PRDM6Q9NQX0 595 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 PILRBQ9UKJ0 227 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 SIPA1L1O43166 1804 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 PSG2P11465 335 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 RAB1CQ92928 201 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 RNF122Q9H9V4 155 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 THY1P04216 161 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 KIR2DS2P43631 304 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 CBLN2Q8IUK8 224 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 OR1L4Q8NGR5 311 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM210BQ96KR6 192 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 SEC14L6B5MCN3 397 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 CEBPEQ15744 281 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 TNXAQ16473 311 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 OR10D4PQ8NGN7 298 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 NAT8BQ9UHF3 227 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 CA11O75493 328 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 PAX6P26367 422 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 IGSF11Q5DX21 431 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 VWCEQ96DN2 955 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 SPSB2Q99619 263 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 AAMDCQ9H7C9 122 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 SH2D2AQ9NP31 389 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 EGR4Q05215 589 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF260Q3ZCT1 412 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 AWAT1Q58HT5 328 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 LYPD8Q6UX82 237 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 OR4A4PQ8NGN8 299 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 IFI6P09912 130 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 GAMTQ14353 236 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 SPNS3Q6ZMD2 512 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 GYPAP02724 150 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 IGKV3-11P04433 115 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 FCER1GP30273 86 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 GNG4P50150 75 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNRF4Q8WWF5 429 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 RAB1BQ9H0U4 201 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 TNFSF18Q9UNG2 199 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1W2PPE3 182 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 PMCHP20382 165 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1W2PNV4 684 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 CXCL2P19875 107 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM50BP56557 158 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 ETFRF1Q6IPR1 90 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-202ENST00000392011 MED12Q93074 2177 aa14.96□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC23A3Q6PIS1 610 aa14.96□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 Q9N2K0 584 aa14.96□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 C16orf97H3BN30 126 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 SULT1A1P50225 295 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 C1orf100Q5SVJ3 147 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM214BQ7L5A3 538 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 OR4F17Q8NGA8 305 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 CD82P27701 267 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 CCL8P80075 99 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 VAX1Q5SQQ9 334 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 STPG1Q5TH74 334 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 VSTM2AQ8TAG5 236 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 S100A4P26447 101 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 BSXQ3C1V8 233 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF519Q8TB69 540 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 AICDAQ9GZX7 198 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 NHLH2Q02577 135 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 CEACAM21Q3KPI0 293 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 CDCP2Q5VXM1 449 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 SSX7Q7RTT5 188 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 ISG15P05161 165 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 TEX30Q5JUR7 227 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms