RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381218.8

ZBED1-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED1, Length 2,832 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-201ENST00000381218 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa13.11□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 CLDN34H7C241 214 aa13.11□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP13.11□□□□□ -0.311e-9■■■■■ 35.7
ZBED1-201ENST00000381218 FAM189A2Q15884 450 aa13.11□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 SLC23A3Q6PIS1 610 aa13.11□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 MAGT1Q9H0U3 335 aa13.11□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 ZNF850A8MQ14 1090 aa13.11□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 CST7O76096 145 aa13.11□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 RFPL3SP0C7P2 107 aa13.11□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 CTSSP25774 331 aa13.11□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 H3F3AP84243 136 aa13.11□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 PHYHD1Q5SRE7 291 aa13.11□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 FAM89BQ8N5H3 189 aa13.11□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 GJC3Q8NFK1 279 aa13.11□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 TMEM37Q8WXS4 190 aa13.11□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 GPHA2Q96T91 129 aa13.11□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 IGHV3-9P01782 118 aa13.1□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 ERVS71-1P61550 626 aa13.1□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 IL11RAQ14626 422 aa13.1□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 PRSS8Q16651 343 aa13.1□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 KIAA1456Q9P272 454 aa13.1□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa13.1□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 NPIPA2E9PIF3 369 aa13.1□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 NPIPA3F8WFD2 350 aa13.1□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 RAB4AP20338 218 aa13.1□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 HERPUD1Q15011 391 aa13.1□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 MPV17LQ2QL34 196 aa13.1□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 ABCA11PQ4W5N1 156 aa13.1□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 SPINK14Q6IE38 97 aa13.1□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 ALKBH2Q6NS38 261 aa13.1□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 ZNF66Q6ZN08 573 aa13.1□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 SSC4DQ8WTU2 575 aa13.1□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 TMEM54Q969K7 222 aa13.1□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 ANGPTL4Q9BY76 406 aa13.1□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 PRR14LQ5THK1 2151 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 A0A1B0GW64 132 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 ST8SIA3O43173 380 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 IMMP1LQ96LU5 166 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 SYT3Q9BQG1 590 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 CLN3Q13286 438 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 PPA1Q15181 289 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 EXT1Q16394 746 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 C10orf128Q5T292 105 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 GPR157Q5UAW9 335 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 SLC35E3Q7Z769 313 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 OR10A7Q8NGE5 316 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 TMEM171Q8WVE6 324 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 ADGRG7Q96K78 797 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 GPR173Q9NS66 373 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 PLA2G3Q9NZ20 509 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 DKKL1Q9UK85 242 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 LAMP3Q9UQV4 416 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 PIGLQ9Y2B2 252 aa13.09□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 TRAPPC6AO75865 159 aa13.08□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 LIFP15018 202 aa13.08□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 FOLR3P41439 243 aa13.08□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 SSR4P51571 173 aa13.08□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 RPP30P78346 268 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 GNMTQ14749 295 aa13.08□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 OR2AE1Q8NHA4 323 aa13.08□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 OR14L1PQ8NHC6 308 aa13.08□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 CT55Q8WUE5 264 aa13.08□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 CALHM2Q9HA72 323 aa13.08□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 LRFN1Q9P244 771 aa13.08□□□□□ -0.31
ZBED1-201ENST00000381218 PCSK5Q92824 1860 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED1-201ENST00000381218 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
ZBED1-201ENST00000381218 ZIC3O60481 467 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED1-201ENST00000381218 VAMP5O95183 116 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED1-201ENST00000381218 SPINK2P20155 84 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED1-201ENST00000381218 WNT5AP41221 380 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED1-201ENST00000381218 ELLP55199 621 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
ZBED1-201ENST00000381218 ANKRD39Q53RE8 183 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED1-201ENST00000381218 PRR18Q8N4B5 295 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED1-201ENST00000381218 CLDND2Q8NHS1 167 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED1-201ENST00000381218 PROK2Q9HC23 129 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED1-201ENST00000381218 ANXA10Q9UJ72 324 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED1-201ENST00000381218 IGSF23A1L1A6 192 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED1-201ENST00000381218 TNFSF11O14788 317 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED1-201ENST00000381218 DHHO43323 396 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED1-201ENST00000381218 IGLV3-1P01715 115 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED1-201ENST00000381218 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
ZBED1-201ENST00000381218 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
ZBED1-201ENST00000381218 EPHA1P21709 976 aa13.08□□□□□ -0.32
ZBED1-201ENST00000381218 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms