RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM30AQ9NV96 361 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF117Q03924 483 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 OR10S1Q8NGN2 331 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 TUBD1Q9UJT1 453 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 TRGC2P03986 189 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 FAM157CP0CG43 387 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 MED12LQ86YW9 2145 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 OR1N1Q8NGS0 311 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 FGF21Q9NSA1 209 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM250H0YL14 139 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 CRYAAP02489 173 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 KIR3DL2P43630 455 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 CTSVO60911 334 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 MISP3Q96FF7 219 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 HIKESHIQ53FT3 197 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 ANKRD37Q7Z713 158 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 FAM221AA4D161 298 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 LINC01553A4QN01 128 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 CNTD2Q9H8S5 307 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 CBLN4Q9NTU7 201 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 KCNE5Q9UJ90 142 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 K7ESF4 209 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 FGF17O60258 216 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 CD40P25942 277 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 PSG5Q15238 335 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 HHIPQ96QV1 700 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 EMC6Q9BV81 110 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 PLXNB1O43157 2135 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 FZD5Q13467 585 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 PDFQ9HBH1 243 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 A0A1B0GW15 77 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 CEACAM3P40198 252 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 GUCA2BQ16661 112 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 HYAL1Q12794 435 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 TCF24Q7RTU0 167 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 GHITMQ9H3K2 345 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 LTB4R2Q9NPC1 389 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 PROCRQ9UNN8 238 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 TNFSF11O14788 317 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 RAB9AP51151 201 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 IER2Q9BTL4 223 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF880Q6PDB4 577 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 EMDP50402 254 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 ERV3-1Q14264 604 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 LDLRAD3Q86YD5 345 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 FAM90A26D6RGX4 464 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 RELQ04864 619 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF79Q15937 498 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 NPIPB8E9PQR5 432 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 H0Y980 276 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 NPIPB7O75200 414 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 COMPP49747 757 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 SELENOTP62341 195 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 R3HDM4Q96D70 268 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 MRGPRX3Q96LB0 322 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 LOC285556D6RIA3 1793 aa7.28□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 TIMP1P01033 207 aa7.27□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 PPYP01298 95 aa7.27□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 MYBPHQ13203 477 aa7.27□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 SPNS3Q6ZMD2 512 aa7.27□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 GPR27Q9NS67 375 aa7.27□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 OR51B4Q9Y5P0 310 aa7.27□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 hADV38S2A0JD32 116 aa7.27□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 A1L4Q6 167 aa7.27□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 GHRHP01286 108 aa7.27□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 C12orf49Q9H741 205 aa7.27□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 CACNA1EQ15878 2313 aa7.27□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 CYR61O00622 381 aa7.27□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 CHST1O43916 411 aa7.27□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 OR3A4PP47883 348 aa7.27□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 MPC1Q9Y5U8 109 aa7.27□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 PLA2G10O15496 165 aa7.27□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 PQLC2Q6ZP29 291 aa7.27□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 C17orf47Q8NEP4 570 aa7.27□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 SIRT5Q9NXA8 310 aa7.27□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms