RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 PTAFRP25105 342 aa15.04■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 AESQ08117 197 aa15.04■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 IL15RAQ13261 267 aa15.04■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 LIAT1Q6ZQX7 453 aa15.04■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 CD177Q8N6Q3 437 aa15.04■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 GLYATL2Q8WU03 294 aa15.04■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa15.04■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 TP53RKQ96S44 253 aa15.04■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 PLCE1Q9P212 2302 aa15.03■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 RNF222A6NCQ9 220 aa15.03■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 POM121CA8CG34 1229 aa15.03■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 GPR31O00270 319 aa15.03■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 RP2O75695 350 aa15.03■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 OR3A1P47881 315 aa15.03■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 SELENOVP59797 346 aa15.03■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 BSPH1Q075Z2 132 aa15.03■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 TBC1D26Q86UD7 250 aa15.03■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 NUP37Q8NFH4 326 aa15.03■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 A0A0D9SG52 128 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 SRRM5B3KS81 715 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 RAB32Q13637 225 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 LYZL2Q7Z4W2 148 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 FAM185AQ8N0U4 392 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 KCNRGQ8N5I3 272 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 OR10Z1Q8NGY1 313 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 LHFPL5Q8TAF8 219 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 DCUN1D4Q92564 292 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 COQ2Q96H96 371 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 C18orf12Q96KH6 178 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 TAF9BQ9HBM6 251 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 UBQLN2Q9UHD9 624 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 KIF25Q9UIL4 384 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 OR2W1Q9Y3N9 320 aa15.02■□□□□ -0
ACTB-201ENST00000331789 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa15.02□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 IFNA21P01568 189 aa15.02□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 IGHV1-46P01743 117 aa15.02□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 PRDX2P32119 198 aa15.02□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 CASP6P55212 293 aa15.02□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 RND3P61587 244 aa15.02□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 HMGN3Q15651 99 aa15.02□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 SLC35E4Q6ICL7 350 aa15.02□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa15.02□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 GCSAMQ8N6F7 178 aa15.02□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 LRTM2Q8N967 370 aa15.02□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 OR5AC2Q9NZP5 309 aa15.02□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 MAB21L2Q9Y586 359 aa15.02□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 IFNL4K9M1U5 179 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 OR2F2O95006 317 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 PSG2P11465 335 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 CA7P43166 264 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 ID4P47928 161 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 OR2F1Q13607 317 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 LGI3Q8N145 548 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 CFHR2P36980 270 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 S100A10P60903 97 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 ZNF345Q14585 488 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 OR1L1Q8NH94 360 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 SHARPINQ9H0F6 387 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 DNAJB11Q9UBS4 358 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 TNFSF12O43508 249 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 GLIPR1P48060 266 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 TESK1Q15569 626 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 PRSS54Q6PEW0 395 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 FOXRED2Q8IWF2 684 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 TPRX1Q8N7U7 411 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 KCNIP1Q9NZI2 227 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 CACNA1DQ01668 2161 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 ARID1AO14497 2285 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 CCL21O00585 134 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 HSPA12AO43301 675 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 LHBP01229 141 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 LYL1P12980 280 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 CEACAM6P40199 344 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 ADIPOQQ15848 244 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 KRBOX4Q5JUW0 171 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 FAM201AQ5SY85 155 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 OR10V1Q8NGI7 309 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 TMEM222Q9H0R3 208 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 C12orf77C9JDV5 145 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms