RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 CLLU1Q5K131 121 aa9.28□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 NEURL2Q9BR09 285 aa9.28□□□□□ -0.92
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CLN8-201ENST00000331222 IQCJQ1A5X6 159 aa9.28□□□□□ -0.92
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CLN8-201ENST00000331222 MMP26Q9NRE1 261 aa9.28□□□□□ -0.92
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CLN8-201ENST00000331222 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 PGA3P0DJD8 388 aa9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 STPG1Q5TH74 334 aa9.26□□□□□ -0.93
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