RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 RAB7AP51149 207 aa18.28■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 PRSS12P56730 875 aa18.28■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa18.28■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa18.28■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 OR5T1Q8NG75 326 aa18.28■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 DDIT4LQ96D03 193 aa18.28■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 SLC7A10Q9NS82 523 aa18.28■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 TFF2Q03403 129 aa18.27■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 MYBPHQ13203 477 aa18.27■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa18.27■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 FAM131CQ96AQ9 280 aa18.27■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 MRGPRX4Q96LA9 322 aa18.27■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 FOXJ2Q9P0K8 574 aa18.27■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa18.27■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 CLEC18AA5D8T8 446 aa18.27■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 VDAC1P21796 283 aa18.27■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa18.27■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 CLEC18CQ8NCF0 446 aa18.27■□□□□ 0.52
ODC1-201ENST00000234111 YPEL1O60688 119 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 IL3RAP26951 378 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 C1orf61Q13536 156 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 RTL10Q7L3V2 364 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 LHX4Q969G2 390 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 YPEL2Q96QA6 119 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 TMEM106BQ9NUM4 274 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 LTBP2Q14767 1821 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 A0A1W2PNV4 684 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 TNFRSF10CO14798 259 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 TEX43Q6ZNM6 134 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 Q6ZWC4 215 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 GAPTQ8N292 157 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 PPIAL4AQ9Y536 164 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 LNP1A1A4G5 178 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 RPS18P62269 152 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 FAM78BQ5VT40 261 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 ANAPC16Q96DE5 110 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 MANBALQ9NQG1 85 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 CHRNB4P30926 498 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 CHRNA7P36544 502 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 RPL15P61313 204 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 ARL16Q0P5N6 197 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 TMEM41BQ5BJD5 291 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 TMEM196Q5HYL7 178 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 ST8SIA1Q92185 356 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 A0A0G2JRQ6 117 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 A0A0U1RQV5 110 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 ANKUB1A6NFN9 424 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 EFNA2O43921 213 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 GYPAP02724 150 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 COL9A1P20849 921 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 SRP14P37108 136 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 PRDX4Q13162 271 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 Q6ZSR6 202 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 PTPRSQ13332 1948 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 A0A0G2JNG1 304 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 VSTM2BA6NLU5 285 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 ZNF814B7Z6K7 855 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 KIR2DS3K7RE56 304 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 CDKN1AP38936 164 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 KIR2DS5Q14953 304 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 TMEM183BQ1AE95 376 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 CMTM2Q8TAZ6 248 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 IMMP2LQ96T52 175 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 RNF150Q9ULK6 438 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 A0A0U1RQK1 487 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 ZNF320A2RRD8 509 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 POU2F2P09086 479 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 GATAD1Q8WUU5 269 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 C22orf15Q8WYQ4 148 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 PCED1AQ9H1Q7 454 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 SOHLH2Q9NX45 425 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 GRIFINA4D1Z8 144 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 IGKV1D-12P01611 117 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 KCNIP4Q6PIL6 250 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 MED12Q93074 2177 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 SLC39A9Q9NUM3 307 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 COPS7AQ9UBW8 275 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 FBXW4P57775 412 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 SSPNQ14714 243 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 SNAI3Q3KNW1 292 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 BATF2Q8N1L9 274 aa18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms