RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		11.04	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		11.04	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	CGB3	P0DN86	165 aa		11.04	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	CGB7	P0DN87	165 aa		11.04	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF20	P17024	532 aa		11.04	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	CDK5R1	Q15078	307 aa		11.04	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	UTF1	Q5T230	341 aa		11.04	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		11.04	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	RNF144B	Q7Z419	303 aa		11.04	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		11.04	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		11.04	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	CNBD2	Q96M20	576 aa		11.04	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		11.03	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	TOR1A	O14656	332 aa		11.03	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	FAM106CP	P0CH98	169 aa		11.03	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	MNDA	P41218	407 aa		11.03	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	PRRX1	P54821	245 aa		11.03	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		11.03	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		11.03	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		11.03	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF529	Q6P280	563 aa		11.03	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		11.03	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	RFT1	Q96AA3	541 aa		11.03	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	KIRREL1	Q96J84	757 aa		11.03	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		11.03	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		11.03	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		11.03	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		11.03	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		11.03	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		11.03	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	LRRC42	Q9Y546	428 aa		11.03	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	PTGES3L	E9PB15	166 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF44	P15621	663 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	OR3A4P	P47883	348 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	ZP1	P60852	638 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	PAX5	Q02548	391 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	CCDC58	Q4VC31	144 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	OR9G1	Q8NH87	305 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	SPACA5	Q96QH8	159 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468		A0A1W2PPI3	338 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	PSMB11	A5LHX3	300 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	CD1A	P06126	327 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	SLC6A1	P30531	599 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	OR56B4	Q8NH76	319 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	TOMM40L	Q969M1	308 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	RPE	Q96AT9	228 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	SMIM19	Q96E16	107 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	B9D2	Q9BPU9	175 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	11.01	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468		J3QR06	171 aa		11	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	DEGS1	O15121	323 aa		11	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	OCM2	P0CE71	109 aa		11	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	MTNR1B	P49286	362 aa		11	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	THBS3	P49746	956 aa		11	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	WNT4	P56705	351 aa		11	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	SCN1B	Q07699	218 aa		11	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	ELP2	Q6IA86	826 aa		11	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		11	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		11	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		11	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	STX19	Q8N4C7	294 aa		11	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		11	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		11	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		11	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		11	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		11	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	NEK6	Q9HC98	313 aa		11	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	CALY	Q9NYX4	217 aa		11	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM212	A6NML5	194 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	FGF16	O43320	207 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	IL1A	P01583	271 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
MUC1-222	ENST00000610468	MYL12A	P19105	171 aa		10.99	□□□□□ -0.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms