RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602632.1

UBE2E3-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, human

TSL 2 BASIC

Gene UBE2E3, Length 446 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2E3-208	ENST00000602632	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	RYR2	Q92736	4967 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632		A0A087X0M5	115 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632		A0A1B0GTI1	187 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632		A0A1B0GX30	115 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	LY6L	H3BQJ8	138 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	AP4M1	O00189	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	CST1	P01037	141 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	OCM2	P0CE71	109 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	CALCB	P10092	127 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	RAP2A	P10114	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	ZNF44	P15621	663 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	BCL3	P20749	454 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	ATP6V1B2	P21281	511 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	OR3A1	P47881	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	GLIPR1	P48060	266 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	NPBWR2	P48146	333 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	POU3F4	P49335	361 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	RAB7A	P51149	207 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	INSL3	P51460	131 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	CXCR4	P61073	352 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	SCN1B	Q07699	218 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	GPR50	Q13585	617 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	HNF4G	Q14541	408 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	UBE2V2	Q15819	145 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	ODF4	Q2M2E3	257 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	DHFR2	Q86XF0	187 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	OR8H3	Q8N146	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	OR56B4	Q8NH76	319 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	C10orf35	Q96D05	121 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	LRGUK	Q96M69	825 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	APOL4	Q9BPW4	351 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	ODAM	A1E959	279 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	CCDC182	A6NF36	153 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	PRR32	B1ATL7	298 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632		H3BSH0	61 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632		J3QR06	171 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	CCRL2	O00421	344 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	MPZL2	O60487	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	ENTPD6	O75354	484 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	OR2H2	O95918	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	IGKV1D-33	P01593	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	IGKV1-33	P01594	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	KRT8	P05787	483 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	CSN2	P05814	226 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	ELANE	P08246	267 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	ANXA8	P13928	327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	VDAC1	P21796	283 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	CCL1	P22362	96 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	PRKACB	P22694	351 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	MTCP1	P56278	107 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	MADCAM1	Q13477	382 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	DEFB136	Q30KP8	78 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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