RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598594.1

PAF1-208, Transcript of PAF1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component, human

TSL 2

Gene PAF1, Length 280 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAF1-208	ENST00000598594	INCA1	Q0VD86	236 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594		Q0VFX4	171 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	BAMBI	Q13145	260 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	OR8B8	Q15620	311 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	FAM201A	Q5SY85	155 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	PLET1	Q6UQ28	207 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	STRADA	Q7RTN6	431 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	CDC20B	Q86Y33	519 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	RNF185	Q96GF1	192 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	RNF157	Q96PX1	679 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	SPACA5	Q96QH8	159 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	ACER3	Q9NUN7	267 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	CALML5	Q9NZT1	146 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	RARRES3	Q9UL19	164 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	SSR3	Q9UNL2	185 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	KIF15	Q9NS87	1388 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PAF1-208	ENST00000598594	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594		K7ERU9	68 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	MMP23A	O75900	390 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	NXPH4	O95158	308 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	NTN1	O95631	604 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	IGHG1	P01857	330 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	MPC1L	P0DKB6	136 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	CT45A10	P0DMU9	189 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	SPI1	P17947	270 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	KLK2	P20151	261 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	DDT	P30046	118 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	FMO3	P31513	532 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	SELENOT	P62341	195 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	ICAM4	Q14773	271 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	NEDD8	Q15843	81 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	LTC4S	Q16873	150 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	CNBD2	Q96M20	576 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF747	Q9BV97	191 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	BCL9	O00512	1426 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594		A0A096LPI6	279 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594		H7C1C5	153 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594		J3KT08	172 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	AGPAT2	O15120	278 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	SLC22A1	O15245	554 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	C1QL1	O75973	258 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	KCNK2	O95069	426 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	TNFSF15	O95150	251 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	CDS2	O95674	445 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	HBZ	P02008	142 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	PRSS1	P07477	247 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	PRSS2	P07478	247 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	TSPAN19	P0C672	248 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	ZBTB25	P24278	435 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	MPG	P29372	298 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	PSMB2	P49721	201 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	CCL23	P55773	120 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	TAS2R46	P59540	309 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	NCALD	P61601	193 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	LCN6	P62502	163 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	RELA	Q04206	551 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	SLC10A1	Q14973	349 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	MEST	Q5EB52	335 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PAF1-208	ENST00000598594	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		4.14	□□□□□ -1.75

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