RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	AVPR2	P30518	371 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	HERV-K104	P61576	105 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM3A	P98173	230 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	PSG4	Q00888	419 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	TGFBR3	Q03167	851 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC10A1	Q14973	349 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	OTP	Q5XKR4	325 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF774	Q6NX45	483 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF573	Q86YE8	665 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289		Q8IYB0	196 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	SVBP	Q8N300	66 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	RNF152	Q8N8N0	203 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	SPERT	Q8NA61	448 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	OR51F2	Q8NH61	342 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	OR1S1	Q8NH92	325 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	CT55	Q8WUE5	264 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	DCUN1D4	Q92564	292 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	APH1A	Q96BI3	265 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	SNX22	Q96L94	193 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	NICN1	Q9BSH3	213 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	RNF126	Q9BV68	326 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNK15	Q9H427	330 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	NSG2	Q9Y328	171 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A0A6YYD4	124 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	OR5B21	A6NL26	309 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289		K7EPK0	472 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	ST8SIA3	O43173	380 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	SNAPIN	O95295	136 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	CDS2	O95674	445 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	SP1	P08047	785 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	SEC11B	P0C7V7	166 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF250	P15622	560 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	SELE	P16581	610 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF708	P17019	499 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	GLRA1	P23415	457 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	GABRR1	P24046	479 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	CHAT	P28329	748 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	DUSP1	P28562	367 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	P2RY1	P47900	373 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	FOXL2	P58012	376 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	RND3	P61587	244 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	PLGLB1	Q02325	96 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	MZT1	Q08AG7	82 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	IL15RA	Q13261	267 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	IL13RA2	Q14627	380 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	GNMT	Q14749	295 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	TAF9	Q16594	264 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	DCAF10	Q5QP82	559 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	SKA3	Q8IX90	412 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	DEFB123	Q8N688	67 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	POC1A	Q8NBT0	407 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	OR2M7	Q8NG81	312 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
PTPRM-215	ENST00000583289	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		3.86	□□□□□ -1.79

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