RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568494.1

ZNRF1-208, Transcript of zinc and ring finger 1, human

TSL 2

Gene ZNRF1, Length 2,046 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNRF1-208	ENST00000568494	FZR1	Q9UM11	496 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNRF1-208	ENST00000568494	TRDC	B7Z8K6	153 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNRF1-208	ENST00000568494	TEX46	H3BTG2	121 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNRF1-208	ENST00000568494	PPY	P01298	95 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNRF1-208	ENST00000568494	ERVK11-1	P61568	191 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF154	Q13106	437 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNRF1-208	ENST00000568494	IL15RA	Q13261	267 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNRF1-208	ENST00000568494	LY6D	Q14210	128 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNRF1-208	ENST00000568494	TMEM187	Q14656	261 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNRF1-208	ENST00000568494	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ZNRF1-208	ENST00000568494	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNRF1-208	ENST00000568494	DCUN1D4	Q92564	292 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNRF1-208	ENST00000568494	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNRF1-208	ENST00000568494	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNRF1-208	ENST00000568494	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNRF1-208	ENST00000568494	SVIL	O95425	2214 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	OR5H1	A6NKK0	313 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	OR5AC1	P0C628	307 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF44	P15621	663 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	HERPUD1	Q15011	391 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	OR8G5	Q8NG78	346 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	IFT22	Q9H7X7	185 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	RHOF	Q9HBH0	211 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	MLNR	O43193	412 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	GLA	P06280	429 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	PGA5	P0DJD9	388 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	FABP6	P51161	128 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	BTN1A1	Q13410	526 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	RAB32	Q13637	225 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	SIRPB1	O00241	398 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	GLI4	P10075	376 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	LYL1	P12980	280 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	STPG2	Q8N412	459 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	GALNT14	Q96FL9	552 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	GTF3C1	Q12789	2109 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	TMEM210	A6NLX4	147 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	TSPAN4	O14817	238 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	DIRAS3	O95661	229 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	OR2H2	O95918	312 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	TK1	P04183	234 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	KITLG	P21583	273 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	KIR2DS4	P43632	304 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	KIR2DS1	Q14954	304 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494		Q6ZR03	302 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494		Q8IYB0	196 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	SYT3	Q9BQG1	590 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	ESPL1	Q14674	2120 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	NXPH2	O95156	264 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	IFNA21	P01568	189 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	TUBG1	P23258	451 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	GNRHR	P30968	328 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	TIMP3	P35625	211 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	KCNJ3	P48549	501 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF83	P51522	516 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	S100A10	P60903	97 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		11.25	□□□□□ -0.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms