RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 LIN54Q6MZP7 749 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF497Q6ZNH5 498 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAHD2AQ96GK7 314 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 RASL12Q9NYN1 266 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 NPTNQ9Y639 398 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM172BPA6NC97 362 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 M0R233 179 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRB1P04280 392 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 LMO1P25800 156 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIR2DS4P43632 304 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 COL10A1Q03692 680 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIR2DS1Q14954 304 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SHEQ5VZ18 495 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF880Q6PDB4 577 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ERGIC1Q969X5 290 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FXYD6Q9H0Q3 95 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 GCM1Q9NP62 436 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 DNAJB11Q9UBS4 358 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 WIPI2Q9Y4P8 454 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC22A5O76082 557 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 AADACP22760 399 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ECI1P42126 302 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 GZMKP49863 264 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 HERPUD1Q15011 391 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM128Q5BJH2 165 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM201AQ5SY85 155 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF843Q8N446 348 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 CD177Q8N6Q3 437 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 PIPOXQ9P0Z9 390 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 LHBP01229 141 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF728P0DKX0 622 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 PSG2P11465 335 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRDX2P32119 198 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCL8P80075 99 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 DHODHQ02127 395 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC9A3R2Q15599 337 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 MST1LQ2TV78 715 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 C11orf88Q6PI97 169 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM90A1Q86YD7 464 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q8TCH9 128 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 PIK3IP1Q96FE7 263 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 DHRS9Q9BPW9 319 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 B9A039 149 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 H7C1Q1 480 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 IFNL4K9M1U5 179 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 CD80P33681 288 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 GABRA2P47869 451 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 H2BFSP57053 126 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 HERV-K104P61576 105 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 HLA-DRB3P79483 266 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM209AQ5JX71 171 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 DCAF12L2Q5VW00 463 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCTD9Q7L273 389 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR2T35Q8NGX2 323 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 MITD1Q8WV92 249 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 DECR2Q9NUI1 292 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRR13Q9NZ81 148 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNF7Q9UBF6 113 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 TK1P04183 234 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR3A1P47881 315 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 AESQ08117 197 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 TESK1Q15569 626 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q5BKY6 102 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLEC18BQ6UXF7 455 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 UBALD1Q8TB05 177 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZFAND1Q8TCF1 268 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 MOB3AQ96BX8 217 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 PHB2Q99623 299 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 DYSFO75923 2080 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR2A4O95047 310 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 SFT2D2O95562 160 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPYP01298 95 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 GIPP09681 153 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 TNFRSF1AP19438 455 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ERP29P30040 261 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 GAPTQ8N292 157 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRR18Q8N4B5 295 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms