RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	TCF21	O43680	179 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	IFNA1	P01562	189 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	HLA-DPB1	P04440	258 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	SCGB1A1	P11684	91 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	CRISP2	P16562	243 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF30	P17039	623 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	ALDH3A1	P30838	453 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	MARCKSL1	P49006	195 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	MEOX2	P50222	304 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	GZMM	P51124	257 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	P2RY4	P51582	365 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	CCL23	P55773	120 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	BTN3A2	P78410	334 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	CRADD	P78560	199 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	PMVK	Q15126	192 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	ELP2	Q6IA86	826 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	GLYAT	Q6IB77	296 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	PLET1	Q6UQ28	207 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF550	Q7Z398	422 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	DRAM1	Q8N682	238 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR26	Q8NDV2	337 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	OR1P1	Q8NH06	330 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	NEURL3	Q96EH8	262 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNS1	Q96KK3	526 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	SOST	Q9BQB4	213 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	CLMP	Q9H6B4	373 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	BIN3	Q9NQY0	253 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	PARP11	Q9NR21	331 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	GLS2	Q9UI32	602 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	NPAT	Q14207	1427 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0G2JMP0	313 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0J9YXY3	114 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	GYG2	O15488	501 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	CA11	O75493	328 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	MMP23A	O75900	390 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	ARL6IP5	O75915	188 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2A4	O95047	310 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	TTR	P02766	147 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	FABP3	P05413	133 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP5G1	P05496	136 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	CRYBA1	P05813	215 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	GABRA1	P14867	456 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	APOF	Q13790	326 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	IRF4	Q15306	451 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	RSU1	Q15404	277 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	CCL15	Q16663	113 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		2	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	TEX30	Q5JUR7	227 aa		2	□□□□□ -2.09

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