RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	OR2T29	Q8NH02	315 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	ABHD3	Q8WU67	409 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF138	Q8WVD3	245 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	RCN3	Q96D15	328 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM210B	Q96KR6	192 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	WDR54	Q9H977	334 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	NOX3	Q9HBY0	568 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308		V9GYY9	64 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A0A6YYD5	115 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1B0GVX0	72 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB19	A4D1S5	217 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	KLLN	B2CW77	178 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	DFFA	O00273	331 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	KLRC4	O43908	158 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	OR2B3	O76000	313 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	GCG	P01275	180 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	PRKACB	P22694	351 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	GGT2	P36268	569 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	HCCS	P53701	268 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	CDKN2D	P55273	166 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	SYNJ2BP	P57105	145 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	ERCC8	Q13216	396 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	XRCC4	Q13426	336 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	MADCAM1	Q13477	382 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	MPPED2	Q15777	294 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	PCP2	Q8IVA1	136 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	OR51A7	Q8NH64	312 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	PIFO	Q8TCI5	191 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM104A	Q969W3	186 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF799	Q96GE5	643 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	TREM1	Q9NP99	234 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	DYSF	O75923	2080 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	OR6C74	A6NCV1	312 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	TVP23A	A6NH52	213 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	C2orf74	A8MZ97	194 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	C19orf84	I3L1E1	186 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	SERPINA7	P05543	415 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	BGN	P21810	368 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	GNRHR	P30968	328 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	SSTR5	P35346	364 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	SPINT3	P49223	89 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	TAS2R46	P59540	309 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	TPI1	P60174	286 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	TNXA	Q16473	311 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	AVPI1	Q5T686	147 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	CPTP	Q5TA50	214 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	RESP18	Q5W5W9	173 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	KCTD16	Q68DU8	428 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	DUPD1	Q68J44	220 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308		Q6ZVH6	145 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	LCN9	Q8WX39	176 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM234	Q8WY98	164 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	HAUS1	Q96CS2	278 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	OR2A5	Q96R48	311 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	LYSMD1	Q96S90	227 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	TIMM17A	Q99595	171 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	SYT4	Q9H2B2	425 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SNHG1-222	ENST00000545308	OR51B5	Q9H339	312 aa		2.66	□□□□□ -1.98

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