RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527224.1

PACS1-205, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PACS1, Length 3,024 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-205ENST00000527224 ATOH7Q8N100 152 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-205ENST00000527224 SAMD10Q9BYL1 202 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-205ENST00000527224 TXNIPQ9H3M7 391 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-205ENST00000527224 TBX21Q9UL17 535 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-205ENST00000527224 OBSL1O75147 1896 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-205ENST00000527224 EGR1P18146 543 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-205ENST00000527224 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
PACS1-205ENST00000527224 COMPP49747 757 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
PACS1-205ENST00000527224 ARL6IP1Q15041 203 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-205ENST00000527224 AGBL5Q8NDL9 886 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-205ENST00000527224 ZNF738Q8NE65 137 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-205ENST00000527224 CSTL1Q9H114 145 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-205ENST00000527224 PLK3Q9H4B4 646 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-205ENST00000527224 C11orf1Q9H5F2 150 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-205ENST00000527224 ZNF286AQ9HBT8 521 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-205ENST00000527224 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
PACS1-205ENST00000527224 COX11Q9Y6N1 276 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-205ENST00000527224 ATG2BQ96BY7 2078 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 SLC35E2P0CK97 266 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 LINC00310P59036 64 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 ZNF321PQ8N8H1 164 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 SLC38A9Q8NBW4 561 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 FAM3CQ92520 227 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 PIGTQ969N2 578 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 A0A1W2PN81 502 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 TPPP2P59282 170 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 PDCD1Q15116 288 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 KISS1Q15726 138 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 VAMP3Q15836 100 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 TM4SF19Q96DZ7 209 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 F6UZH7 168 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 GDF9O60383 454 aa16.07■□□□□ 0.16
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PACS1-205ENST00000527224 RNF133Q8WVZ7 376 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 WIPI2Q9Y4P8 454 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 GYPAP02724 150 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 PPBPP02775 128 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 MTCP1P56278 107 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 RIPPLY3P57055 190 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 RPL15P61313 204 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 FIGLAQ6QHK4 219 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 POLR1DQ9Y2S0 133 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 AQP7P3A6NL99 342 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 CIDEAO60543 219 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 HYPMO75409 117 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 SERPINA7P05543 415 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 RPL19P84098 196 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 Q5PR19 223 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 OR8B12Q8NGG6 310 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 OR4F5Q8NH21 305 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 OR4F4Q96R69 305 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 WNT10AQ9GZT5 417 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 LYRM4Q9HD34 91 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 FBXL7Q9UJT9 491 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 SERPINE3A8MV23 424 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 FAM89BQ8N5H3 189 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 OR5AU1Q8NGC0 362 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 SPPL3Q8TCT6 385 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 C11orf40Q8WZ69 217 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 NUDT22Q9BRQ3 303 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 TBC1D29Q9UFV1 150 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 PGPEP1LA6NFU8 196 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 ZNF695Q8IW36 515 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 ANGPTL7O43827 346 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 IFNA5P01569 189 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 ECI1P42126 302 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 SGCBQ16585 318 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 SPIN3Q5JUX0 258 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 OR2V1Q8NHB1 315 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 LHX4Q969G2 390 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 OR10A5Q9H207 317 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 HOXA2O43364 376 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 WASP42768 502 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 MRGPRGQ86SM5 289 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 LINC01551Q86U37 167 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 CCL4L1Q8NHW4 92 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 PSMF1Q92530 271 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 STARD4Q96DR4 205 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 OR6C1Q96RD1 312 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 RNF2Q99496 336 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 WWTR1Q9GZV5 400 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 NECAP2Q9NVZ3 263 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 PXMP4Q9Y6I8 212 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-205ENST00000527224 GTF3C1Q12789 2109 aa16.04■□□□□ 0.16
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