RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 ABCB10Q9NRK6 738 aa3.41□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 INPP5EQ9NRR6 644 aa3.41□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 CENPMQ9NSP4 180 aa3.41□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 C1orf123Q9NWV4 160 aa3.41□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 ZNRD1Q9P1U0 126 aa3.41□□□□□ -1.86
HDAC2-216ENST00000523628 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
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HDAC2-216ENST00000523628 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
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HDAC2-216ENST00000523628 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa3.4□□□□□ -1.87
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HDAC2-216ENST00000523628 DYNC1I1O14576 645 aa3.4□□□□□ -1.87
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HDAC2-216ENST00000523628 WDR82Q6UXN9 313 aa3.4□□□□□ -1.87
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HDAC2-216ENST00000523628 OR2T27Q8NH04 317 aa3.4□□□□□ -1.87
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HDAC2-216ENST00000523628 CCT8L2Q96SF2 557 aa3.4□□□□□ -1.87
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HDAC2-216ENST00000523628 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa3.39□□□□□ -1.87
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HDAC2-216ENST00000523628 A0A1W2PS18 150 aa3.39□□□□□ -1.87
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HDAC2-216ENST00000523628 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 ALOX5APP20292 161 aa3.39□□□□□ -1.87
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