RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515854.5

ATP2C1-223, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, human

TSL 4

Gene ATP2C1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2C1-223	ENST00000515854	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	TMEM165	Q9HC07	324 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	OPN4	Q9UHM6	478 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	GLS2	Q9UI32	602 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	RTTN	Q86VV8	2226 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATP2C1-223	ENST00000515854	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	PLSCR5	A0PG75	271 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854		A6NLC8	198 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	HMSD	A8MTL9	139 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	SRRM5	B3KS81	715 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCL21	O00585	134 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	HSPB6	O14558	160 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	ABCD4	O14678	606 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	SPRY3	O43610	288 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	PSPN	O60542	156 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF205	O95201	554 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	DIRAS3	O95661	229 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	LHB	P01229	141 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	PPY	P01298	95 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	IGHV1-46	P01743	117 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	CD55	P08174	381 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC25A4	P12235	298 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	EPHA1	P21709	976 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	AADAC	P22760	399 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	CHRNB4	P30926	498 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	KCNJ3	P48549	501 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF81	P51508	661 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	RND3	P61587	244 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	HLA-DRB3	P79483	266 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	PAX5	Q02548	391 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	BSPH1	Q075Z2	132 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	BAMBI	Q13145	260 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	LY6D	Q14210	128 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	HMGN3	Q15651	99 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	ADIPOQ	Q15848	244 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	SPRN	Q5BIV9	151 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	IGSF11	Q5DX21	431 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	LIN54	Q6MZP7	749 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	C11orf88	Q6PI97	169 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	VHLL	Q6RSH7	139 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	COQ8A	Q8NI60	647 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	FAM222B	Q8WU58	562 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	LRRC29	Q8WV35	223 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	ERGIC1	Q969X5	290 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	GALNT14	Q96FL9	552 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	OR2V2	Q96R30	315 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	DIRC2	Q96SL1	478 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	RAB18	Q9NP72	206 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	NGB	Q9NPG2	151 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	IL19	Q9UHD0	177 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	HSPB11	Q9Y547	144 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	FRY	Q5TBA9	3013 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	GTF3C1	Q12789	2109 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		3.76	□□□□□ -1.81

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