RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 ECSITQ9BQ95 431 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 VPS25Q9BRG1 176 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 TMEM208Q9BTX3 173 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF426Q9BUY5 554 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 COMMD4Q9H0A8 199 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 ARV1Q9H2C2 271 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 POPDC2Q9HBU9 364 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 SLC2A9Q9NRM0 540 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 COPZ2Q9P299 210 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF221Q9UK13 617 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 RAB26Q9ULW5 256 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 BAIAP2Q9UQB8 552 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 MEMO1Q9Y316 297 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 CR1P17927 2039 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 ZANQ9Y493 2812 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 A0A0G2JMP0 313 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 A0A0U1RRA0 63 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 A0A0X1KG70 313 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 ISPDA4D126 451 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 USP27XA6NNY8 438 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 OR11H12B2RN74 326 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 F5H5T6 163 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 PDXKO00764 312 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 AZIN1O14977 448 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 RS1O15537 224 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 TGOLN2O43493 480 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 CHST10O43529 356 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 GGCTO75223 188 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 OR2F2O95006 317 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 OR4F21O95013 312 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 SCELO95171 688 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 PTTG1O95997 202 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 HTR1AP08908 422 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 RRASP10301 218 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 GZMHP20718 246 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 UQCRC2P22695 453 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 SDC4P31431 198 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 S100A11P31949 105 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 SSTR5P35346 364 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 AKR1C3P42330 323 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 RBM34P42696 430 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 CSNK1A1P48729 337 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 PPOXP50336 477 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 PPT1P50897 306 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 OR4D2P58180 307 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 RAB2AP61019 212 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 NCALDP61601 193 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 PKIAP61925 76 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 RAP1AP62834 184 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 RPL32P62910 135 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 SLC10A7Q0GE19 358 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 INCA1Q0VD86 236 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 ADIGQ0VDE8 80 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 NME3Q13232 169 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 KCNJ11Q14654 390 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 SPA17Q15506 151 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 OR8G1Q15617 311 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 POU2AF1Q16633 256 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 CYP51A1Q16850 503 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 ATP6V1FQ16864 119 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 MICBQ29980 383 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 SMIM21Q3B7S5 101 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 ACSBG2Q5FVE4 666 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 GCSAMLQ5JQS6 135 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 ASPHD2Q6ICH7 369 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 OR52W1Q6IF63 320 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 UFSP1Q6NVU6 142 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 LEG1Q6P5S2 330 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 DNM1P34Q6PK57 102 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 PLET1Q6UQ28 207 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 SCIMPQ6UWF3 145 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 SERPINA9Q86WD7 417 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 C10orf107Q8IVU9 208 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 SLC35F6Q8N357 371 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 OR11H1Q8NG94 326 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 OR9G4Q8NGQ1 327 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 OR9A4Q8NGU2 314 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 OR10K1Q8NGX5 313 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 OR11H2Q8NH07 326 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 SLC37A2Q8TED4 501 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 ABHD3Q8WU67 409 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 PIH1D2Q8WWB5 315 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 ST8SIA1Q92185 356 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 PTH2Q96A98 100 aa2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms